RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614428.4

ACACA-231, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACACA, Length 9,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-231	ENST00000614428	STH	Q8IWL8	128 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACACA-231	ENST00000614428	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACACA-231	ENST00000614428		H7C423	109 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACACA-231	ENST00000614428	CRIP1	P50238	77 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ACACA-231	ENST00000614428	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		5.09	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	LGALS9	O00182	355 aa		5.09	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428		Q6ZUT4	128 aa		5.09	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	FRY	Q5TBA9	3013 aa		5.09	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	CR1	P17927	2039 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428		H0YGX0	51 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	NXPH4	O95158	308 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	NFE4	Q86UQ8	179 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	KLLN	B2CW77	178 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428		U3KQE9	123 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	RNF114	Q9Y508	228 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	CFAP161	Q6P656	301 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	AMTN	Q6UX39	209 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	KLK9	Q2XQG4	91 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	ITPR1	Q14643	2758 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	VWC2L	B2RUY7	222 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	MIA	Q16674	131 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	TGFA	P01135	160 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428		Q8NA96	180 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	UBE2D3	P61077	147 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	UBE2D2	P62837	147 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428		A4D1N5	150 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428		Q6Q795	121 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	IGKV3-20	P01619	116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	SAP30	O75446	220 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	WFDC2	Q14508	124 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	TMEM243	Q9BU79	118 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	LINC01620	Q4KN68	170 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	PRR31	Q5SQ13	230 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	ATOX1	O00244	68 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	IGHV3-30	P01768	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	PDE6G	P18545	87 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428		A0A0J9YY99	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	APC	P25054	2843 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	MAL	P21145	153 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	TCF15	Q12870	199 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	UBE2D1	P51668	147 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	SS18	Q15532	418 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	CXCL5	P42830	114 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	PRAC2	D3DTV9	90 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	LY6H	O94772	140 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	TCL1B	O95988	128 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	SOCS3	O14543	225 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	PRORY	Q9H606	182 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428		M0QY20	66 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ACACA-231	ENST00000614428	SYNJ2BP	P57105	145 aa		5.04	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.6 ms