RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 CRYBA4P53673 196 aa11.75□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 FAM104BQ5XKR9 115 aa11.75□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 TMEM136Q6ZRR5 245 aa11.75□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa11.74□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 RAB4AP20338 218 aa11.74□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 ZNF56Q15929 161 aa11.74□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 AMN1Q8IY45 258 aa11.74□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 SLC25A29Q8N8R3 303 aa11.74□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 VSIG2Q96IQ7 327 aa11.74□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 GNB1LQ9BYB4 327 aa11.74□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 HHLA3Q9XRX5 114 aa11.74□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 K7EQD1 137 aa11.73□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 SCO1O75880 301 aa11.73□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 MGPP08493 103 aa11.73□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 RHOHQ15669 191 aa11.73□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 SUMO4Q6EEV6 95 aa11.73□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 LRP1BQ9NZR2 4599 aa11.72□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.72□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.72□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 M0QY20 66 aa11.72□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 HLA-DQA1P01909 254 aa11.72□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 MT-ND6P03923 174 aa11.72□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 MRAP2Q96G30 205 aa11.72□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 F5H697 171 aa11.71□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 H7C1H1 209 aa11.71□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 PAX4O43316 350 aa11.71□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 LINC00694P0DN24 101 aa11.71□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PACS1-208ENST00000529677 APOBP04114 4563 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 COLCA2A8K830 154 aa11.7□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.7□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa11.68□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 A0A0J9YY99 117 aa11.68□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 PPBPP02775 128 aa11.68□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 P0DMU3 169 aa11.68□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 FAM231AP0DMU4 169 aa11.68□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 FAM231CP0DMU5 169 aa11.68□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.68□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.68□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 DNAJC30Q96LL9 226 aa11.68□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 Q9UF83 564 aa11.68□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa11.67□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.67□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 GYPEP15421 78 aa11.67□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 TCTAP57738 103 aa11.67□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 NIT2Q9NQR4 276 aa11.67□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 GAS8-AS1O95177 125 aa11.66□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 NRACQ8N912 160 aa11.66□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 ICOSQ9Y6W8 199 aa11.66□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 A0A096LPF7 62 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 IGLL5B9A064 214 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 NCR2O95944 276 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 PPP1R17O96001 155 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 APCSP02743 223 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 RPS10P46783 165 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 UBE2D3P61077 147 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 UBE2D2P62837 147 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 APLNQ9ULZ1 77 aa11.65□□□□□ -0.54
PACS1-208ENST00000529677 D6R8Y8 96 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 SMKR1H3BMG3 65 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 PHOX2AO14813 284 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 RAB5AP20339 215 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 CKS2P33552 79 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 SH2D6Q7Z4S9 175 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 ORMDL3Q8N138 153 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa11.64□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 GAGE12JA6NER3 117 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 GAGE1Q13065 139 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 GAGE4Q13068 117 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 GAGE5Q13069 117 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 GAGE13Q4V321 117 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 LINC00336Q6ZUF6 198 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa11.63□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 SRIP30626 198 aa11.62□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 TIRAPP58753 221 aa11.62□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.62□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 PRELID3AQ96N28 172 aa11.62□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 C20orf78Q9BR46 151 aa11.62□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 TNFRSF6BO95407 300 aa11.61□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 FABP9Q0Z7S8 132 aa11.61□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 NEGR1Q7Z3B1 354 aa11.61□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.61□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 PRSS47A8MTI9 375 aa11.6□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 RTL8CO15255 209 aa11.6□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 NUDT3O95989 172 aa11.6□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 NPYP01303 97 aa11.6□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 KIAA1644Q3SXP7 199 aa11.6□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.6□□□□□ -0.55
PACS1-208ENST00000529677 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
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