RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 NDUFA1O15239 70 aa13.26□□□□□ -0.29
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PTDSS1-202ENST00000517309 DEFB125Q8N687 156 aa13.26□□□□□ -0.29
PTDSS1-202ENST00000517309 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
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PTDSS1-202ENST00000517309 INAFM1C9JVW0 142 aa13.25□□□□□ -0.29
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PTDSS1-202ENST00000517309 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa13.25□□□□□ -0.29
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PTDSS1-202ENST00000517309 PCP2Q8IVA1 136 aa13.24□□□□□ -0.29
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PTDSS1-202ENST00000517309 MUSTN1Q8IVN3 82 aa13.15□□□□□ -0.3
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PTDSS1-202ENST00000517309 DEFB105AQ8NG35 78 aa13.12□□□□□ -0.31
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PTDSS1-202ENST00000517309 ABCA2Q9BZC7 2435 aa13.12□□□□□ -0.31
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PTDSS1-202ENST00000517309 H7C423 109 aa13.09□□□□□ -0.31
PTDSS1-202ENST00000517309 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa13.09□□□□□ -0.31
PTDSS1-202ENST00000517309 hADV29S1A0JD25 119 aa13.09□□□□□ -0.31
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTDSS1-202ENST00000517309 C20orf173Q96LM9 149 aa13.09□□□□□ -0.31
PTDSS1-202ENST00000517309 ACYP1P07311 99 aa13.08□□□□□ -0.32
PTDSS1-202ENST00000517309 UBE2AP49459 152 aa13.08□□□□□ -0.32
PTDSS1-202ENST00000517309 ANKRD29Q8N6D5 301 aa13.08□□□□□ -0.32
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