RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
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RABGGTB-209ENST00000473406 PIRTP0C851 137 aa2.41□□□□□ -2.02
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RABGGTB-209ENST00000473406 PLPP5Q8NEB5 264 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 DCHS1Q96JQ0 3298 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCA3Q99758 1704 aa2.41□□□□□ -2.02
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RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
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RABGGTB-209ENST00000473406 MROH2AA6NES4 1674 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-209ENST00000473406 MYO9AB2RTY4 2548 aa2.39□□□□□ -2.03
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RABGGTB-209ENST00000473406 ITSN2Q9NZM3 1697 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-209ENST00000473406 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa2.39□□□□□ -2.03
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RABGGTB-209ENST00000473406 SPANXN1Q5VSR9 72 aa2.39□□□□□ -2.03
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RABGGTB-209ENST00000473406 C22orf24Q9Y442 160 aa2.39□□□□□ -2.03
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RABGGTB-209ENST00000473406 ABCC3O15438 1527 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-209ENST00000473406 XIRP2A4UGR9 3374 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-209ENST00000473406 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa2.38□□□□□ -2.03
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RABGGTB-209ENST00000473406 AGLP35573 1532 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-209ENST00000473406 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-209ENST00000473406 AKAP11Q9UKA4 1901 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-209ENST00000473406 SNCGO76070 127 aa2.37□□□□□ -2.03
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RABGGTB-209ENST00000473406 PIPP12273 146 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-209ENST00000473406 ODF3Q96PU9 254 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-209ENST00000473406 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
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RABGGTB-209ENST00000473406 C10orf105Q8TEF2 133 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM141Q96I45 108 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-209ENST00000473406 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.36□□□□□ -2.03
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RABGGTB-209ENST00000473406 C12orf57Q99622 126 aa2.34□□□□□ -2.03
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RABGGTB-209ENST00000473406 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC88BA6NC98 1476 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 HIGD1CA8MV81 97 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 MCRIP1C9JLW8 97 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFA11Q86Y39 141 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 SPTA1P02549 2419 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 ZGRF1Q86YA3 2104 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 PLXNA2O75051 1894 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-209ENST00000473406 SPTBN2O15020 2390 aa2.32□□□□□ -2.04
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