RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 SS18Q15532 418 aa2.26□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 Q6AWC8 147 aa2.26□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 C22orf42Q6IC83 251 aa2.26□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 LAIR2Q6ISS4 152 aa2.26□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 C15orf56Q8N910 161 aa2.26□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM101Q96IK0 257 aa2.26□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 ANAPC10Q9UM13 185 aa2.26□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa2.25□□□□□ -2.05
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ECHDC1-211ENST00000460558 A8MWV9 139 aa2.25□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 PTTG1O95997 202 aa2.25□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 TYMSP04818 313 aa2.25□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 AKR1C4P17516 323 aa2.25□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 BTCP35070 178 aa2.25□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 CTAG1AP78358 180 aa2.25□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 REG3AQ06141 175 aa2.25□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA0087Q14695 138 aa2.25□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.25□□□□□ -2.05
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ECHDC1-211ENST00000460558 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.25□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 GLYATL2Q8WU03 294 aa2.25□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 TSKUQ8WUA8 353 aa2.25□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 RAB2BQ8WUD1 216 aa2.25□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 C9orf16Q9BUW7 83 aa2.25□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 TRBV19A0A075B6N1 114 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A1W2PNN7 141 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 COX7A2P2O60397 106 aa2.24□□□□□ -2.05
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ECHDC1-211ENST00000460558 KRTAP10-12P60413 245 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 RBX1P62877 108 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 PDE6HQ13956 83 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 SMCO1Q147U7 214 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 C10orf113Q5VZT2 155 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 COX6B2Q6YFQ2 88 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 C20orf203Q8NBC4 194 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 ZFAND1Q8TCF1 268 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 ASB13Q8WXK3 278 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 PTH2Q96A98 100 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 CARD19Q96LW7 228 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 DUSP21Q9H596 190 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 FKBP14Q9NWM8 211 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 TIMM9Q9Y5J7 89 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 LENEPQ9Y5L5 61 aa2.24□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa2.23□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAV21A0A0B4J279 112 aa2.23□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa2.23□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa2.23□□□□□ -2.05
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ECHDC1-211ENST00000460558 CTRLP40313 264 aa2.23□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 CAV2P51636 162 aa2.23□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 S100A10P60903 97 aa2.23□□□□□ -2.05
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ECHDC1-211ENST00000460558 TERB2Q8NHR7 220 aa2.23□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 GPX8Q8TED1 209 aa2.23□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 PYDC1Q8WXC3 89 aa2.23□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 BCL7BQ9BQE9 202 aa2.23□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 COMMD3Q9UBI1 195 aa2.23□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa2.23□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A0B4J2A0 478 aa2.22□□□□□ -2.05
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ECHDC1-211ENST00000460558 RBAKDNA6NC62 111 aa2.22□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 PEX7O00628 323 aa2.22□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 MED6O75586 246 aa2.22□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 FGF6P10767 208 aa2.22□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 PRSS3P35030 304 aa2.22□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM97Q5BJF2 176 aa2.22□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 LHFPL1Q86WI0 220 aa2.22□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 OR5H6Q8NGV6 325 aa2.22□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 NAA60Q9H7X0 242 aa2.22□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 SHPKQ9UHJ6 478 aa2.22□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
ECHDC1-211ENST00000460558 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa2.21□□□□□ -2.06
ECHDC1-211ENST00000460558 CSN1S1P47710 185 aa2.21□□□□□ -2.06
ECHDC1-211ENST00000460558 SULT1A2P50226 295 aa2.21□□□□□ -2.06
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC38A11Q08AI6 406 aa2.21□□□□□ -2.06
ECHDC1-211ENST00000460558 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
ECHDC1-211ENST00000460558 SPANXN5Q5MJ07 72 aa2.21□□□□□ -2.06
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM74A4Q5TZK3 123 aa2.21□□□□□ -2.06
ECHDC1-211ENST00000460558 IZUMO2Q6UXV1 221 aa2.21□□□□□ -2.06
ECHDC1-211ENST00000460558 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
ECHDC1-211ENST00000460558 NPVFQ9HCQ7 196 aa2.21□□□□□ -2.06
ECHDC1-211ENST00000460558 FNDC10F2Z333 226 aa2.2□□□□□ -2.06
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