RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa0.23□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 J3QLW9 94 aa0.23□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 TFF1P04155 84 aa0.23□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 VMO1Q7Z5L0 202 aa0.23□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM141Q96I45 108 aa0.23□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 ABCA4P78363 2273 aa0.23□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 TENM2Q9NT68 2774 aa0.23□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 MED13LQ71F56 2210 aa0.23□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 RELNP78509 3460 aa0.23□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 HERC2O95714 4834 aa0.23□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 UNC80Q8N2C7 3258 aa0.23□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 A0A0C4DFX4 3053 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 LAMB1P07942 1786 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 DOCK11Q5JSL3 2073 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 SPTA1P02549 2419 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 USP34Q70CQ2 3546 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 A0A087WTM6 91 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 F2Z2F3 143 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC179H3BU77 68 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 NCR2O95944 276 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 SPINK1P00995 79 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC00694P0DN24 101 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 NCS1P62166 190 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 IFI27L1Q96BM0 104 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 PRR15LQ9BU68 103 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 ERG28Q9UKR5 140 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 ABCA1O95477 2261 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 MYH6P13533 1939 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 EYSQ5T1H1 3165 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 EP400Q96L91 3159 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 MXRA5Q9NR99 2828 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 TGP01266 2768 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa0.22□□□□□ -2.37
SNORD3E-201ENST00000362899 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP0.21□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 MUC12Q9UKN1 5478 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 COL7A1Q02388 2944 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 MUC3AQ02505 3323 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 DCHS1Q96JQ0 3298 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 KALRNO60229 2985 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 PITX3O75364 302 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC01545Q5VT33 79 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 SAR1AQ9NR31 198 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP0.21□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa0.21□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 BRCA2P51587 3418 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 SVEP1Q4LDE5 3571 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 SPEGQ15772 3267 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 CCL3L1P16619 93 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 NPC2P61916 151 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 SMIM21Q3B7S5 101 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 MIC13Q5XKP0 118 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 CTAGE3PQ8IX95 158 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 VSTM2AQ8TAG5 236 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 MAFIPQ8WZ33 124 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 SMIM3Q9BZL3 60 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 DSPP15924 2871 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM186AA6NE01 2351 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 TPRP12270 2363 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 WNK1Q9H4A3 2382 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 NF1P21359 2839 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 FHAD1B1AJZ9 1412 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 NHSL1Q5SYE7 1610 aa0.2□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 COL12A1Q99715 3063 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 ASPMQ8IZT6 3477 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 RBAKDNA6NC62 111 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 M0R2Z0 102 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 Q5BKY6 102 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 LZICQ8WZA0 190 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 NDUFA12Q9UI09 145 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 CENPFP49454 3210 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 MYO7AQ13402 2215 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 PHIPQ8WWQ0 1821 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 ITPR2Q14571 2701 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 AKAP11Q9UKA4 1901 aa0.19□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 NRXN2Q9P2S2 1712 aa0.18□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 CFAP54Q96N23 3096 aa0.18□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP0.18□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa0.18□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 J3QR89 54 aa0.18□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 M0R129 80 aa0.18□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 PROK2Q9HC23 129 aa0.18□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 COPZ2Q9P299 210 aa0.18□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 C5orf42Q9H799 3197 aa0.18□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.9 ms