RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 K7ERU9 68 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 M0R233 179 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 NPFFO15130 113 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 LYRM1O43325 122 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 TPST1O60507 370 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 NCR2O95944 276 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 TNFP01375 233 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 IGKV1-17P01599 117 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 SLC25A4P12235 298 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 HLA-DRB4P13762 266 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
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MDM2-201ENST00000258148 LYPD1Q8N2G4 141 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 MMGT1Q8N4V1 131 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 LINC00311Q8N616 119 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 NABP2Q9BQ15 211 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa2.96□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 URB1O60287 2271 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
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MDM2-201ENST00000258148 CELSR2Q9HCU4 2923 aa2.95□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 TACC2O95359 2948 aa2.95□□□□□ -1.94
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MDM2-201ENST00000258148 SMIM24O75264 130 aa2.95□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 CLEC2BQ92478 149 aa2.95□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 RAB37Q96AX2 223 aa2.95□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 OR4C12Q96R67 309 aa2.95□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 COMMD3Q9UBI1 195 aa2.95□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 TPRKBQ9Y3C4 175 aa2.95□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa2.95□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 COL6A6A6NMZ7 2263 aa2.95□□□□□ -1.94
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MDM2-201ENST00000258148 H3BRN7 92 aa2.94□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 APOC1P02654 83 aa2.94□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 AZU1P20160 251 aa2.94□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 COPZ1P61923 177 aa2.94□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 CDK6Q00534 326 aa2.94□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 PDE6HQ13956 83 aa2.94□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 NEDD8Q15843 81 aa2.94□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 OR5D14Q8NGL3 314 aa2.94□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 ARL11Q969Q4 196 aa2.94□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 TTTY12Q9BZ98 90 aa2.94□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa2.94□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 DNHD1Q96M86 4753 aa2.94□□□□□ -1.94
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MDM2-201ENST00000258148 TRAV27A0A087WT01 109 aa2.93□□□□□ -1.94
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MDM2-201ENST00000258148 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.92□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 OR10AC1Q8NH08 325 aa2.92□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 GGACTQ9BVM4 153 aa2.92□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 ABCA12Q86UK0 2595 aa2.92□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 APCP25054 2843 aa2.91□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa2.91□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 CD3DP04234 171 aa2.91□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 ELOBQ15370 118 aa2.91□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 LINC00269Q8N2A0 174 aa2.91□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 Q8N2B8 174 aa2.91□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 SFT2D1Q8WV19 159 aa2.91□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 MUCL1Q96DR8 90 aa2.91□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 SDF2Q99470 211 aa2.91□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 CST9LQ9H4G1 147 aa2.91□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 NF1P21359 2839 aa2.91□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 NBASA2RRP1 2371 aa2.91□□□□□ -1.94
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MDM2-201ENST00000258148 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
MDM2-201ENST00000258148 TRACP01848 142 aa2.9□□□□□ -1.94
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MDM2-201ENST00000258148 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.9□□□□□ -1.94
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MDM2-201ENST00000258148 SVEP1Q4LDE5 3571 aa2.89□□□□□ -1.95
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MDM2-201ENST00000258148 SPTBP11277 2137 aa2.89□□□□□ -1.95
MDM2-201ENST00000258148 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
MDM2-201ENST00000258148 DEFB109BQ30KR1 87 aa2.89□□□□□ -1.95
MDM2-201ENST00000258148 FAM19A2Q8N3H0 131 aa2.89□□□□□ -1.95
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