RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC179H3BU77 68 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 SPANXA1Q9NS26 97 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 IGHV4-39P01824 125 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM223A0PJW6 202 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 MUSTN1Q8IVN3 82 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 ODF3Q96PU9 254 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 IGHV1-69P01742 117 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 TMEM219Q86XT9 240 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 SDHAF1A6NFY7 115 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 H3BMM0 161 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 SOCS3O14543 225 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 UBE2WQ96B02 151 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 FAM110AQ9BQ89 295 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 C15orf53Q8NAA6 179 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA11-201ENST00000006015 CACNA1AO00555 2505 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 A0A0J9YX75 114 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 ELANEP08246 267 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 NPFFO15130 113 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 MUC4Q99102 2169 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 M0R2P5 195 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 DEFB1P60022 68 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 CFAP161Q6P656 301 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 F5H697 171 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 LGALS9O00182 355 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 ACACBO00763 2458 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 RHOHQ15669 191 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 FAM223BA6NKX1 122 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 TRIAP1O43715 76 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 FAM159AQ6UWV7 190 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 JPT2Q9H910 190 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 A0A087WWL8 130 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 C2orf82Q6UX34 121 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 F6UB75 175 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 MDFICQ9P1T7 246 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA11-201ENST00000006015 A0A0J9YXY3 114 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 H3BT86 120 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 NDUFA4O00483 81 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 SMIM20Q8N5G0 67 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 CENPEQ02224 2701 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 KLLNB2CW77 178 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 HERV-K104P63124 156 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 CCL19Q99731 98 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 TRAV41A0A0B4J266 112 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 H7C423 109 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 RPL11P62913 178 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 LY6EQ16553 131 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 COX6CP09669 75 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 NRGNQ92686 78 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 A0A0J9YXV3 536 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 FAM74A4Q5TZK3 123 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 LITAFQ99732 161 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXA11-201ENST00000006015 M0QY20 66 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF56Q15929 161 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA11-201ENST00000006015 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA11-201ENST00000006015 MEIG1Q5JSS6 88 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA11-201ENST00000006015 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA11-201ENST00000006015 SPANXDQ9BXN6 97 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA11-201ENST00000006015 SPANXCQ9NY87 97 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA11-201ENST00000006015 POLQO75417 2590 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA11-201ENST00000006015 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA11-201ENST00000006015 TRBV12-3P01733 135 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA11-201ENST00000006015 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA11-201ENST00000006015 ATP5J2P56134 94 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXA11-201ENST00000006015 TIMM21Q9BVV7 248 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF580Q9UK33 172 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXA11-201ENST00000006015 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXA11-201ENST00000006015 ZANQ9Y493 2812 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms