RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 PCP2Q8IVA1 136 aa4.94□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.94□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 CACNA1BQ00975 2339 aa4.94□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 H0Y9J4 135 aa4.94□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 CACNA1HO95180 2353 aa4.94□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 I3L2K1 104 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 K7EN84 100 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 ABCA7Q8IZY2 2146 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 CLUHP3Q96NS8 147 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 TDRG1Q3Y452 100 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 TRPM7Q96QT4 1865 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 VWCEQ96DN2 955 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 LYNX1G3V0Z9 82 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 LYNX1P0DP58 116 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 LYPD2Q6UXB3 125 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 PRSS33Q8NF86 280 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 PTH2Q96A98 100 aa4.93□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 A0A0J9YX75 114 aa4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 A0A0J9YXV3 536 aa4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 TCL1BO95988 128 aa4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 FHL1Q13642 323 aa4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 COL6A6A6NMZ7 2263 aa4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 Q6JHZ5 121 aa4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 COX7CP15954 63 aa4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1B0GW54 56 aa4.91□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.91□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 GTSF1Q8WW33 167 aa4.91□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 AJUBAQ96IF1 538 aa4.91□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 FXYD2P54710 66 aa4.91□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 Q0VFX4 171 aa4.91□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.91□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 K7EIM0 57 aa4.91□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00574Q9H8X3 128 aa4.91□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.91□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 M0QXV9 152 aa4.91□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.9□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.9□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.9□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1B0GXF2 115 aa4.9□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 A6NED7 52 aa4.9□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 G3V318 75 aa4.9□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 CTSGP08311 255 aa4.9□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.9□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 C1orf195Q5TG92 126 aa4.9□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM105Q8N8V8 129 aa4.9□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 C7orf33Q8WU49 177 aa4.9□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 IGKV1-17P01599 117 aa4.9□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 C5orf38Q86SI9 138 aa4.9□□□□□ -1.62
SCN2A-209ENST00000636071 VPREB1P12018 145 aa4.9□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 DOCK7Q96N67 2140 aa4.9□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 CACNA1GO43497 2377 aa4.9□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 PTPRDP23468 1912 aa4.9□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa4.9□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.9□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.9□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 ROS1P08922 2347 aa4.9□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 Q6ZR03 302 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 RNF223E7ERA6 249 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 C20orf197Q8N268 126 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 RNF183Q96D59 192 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 BCE1O60756 84 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 NCOR1O75376 2440 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 J3QKU1 62 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 P0C879 139 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 WFDC2Q14508 124 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 WFDC11Q8NEX6 87 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 EPOPA6NHQ4 379 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF407Q9C0G0 2248 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 Q96MF0 132 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.89□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 C2orf70A6NJV1 201 aa4.88□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.88□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 SIPA1L1O43166 1804 aa4.88□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 IGFL2Q6UWQ7 119 aa4.88□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.88□□□□□ -1.63
SCN2A-209ENST00000636071 CFHR3Q02985 330 aa4.88□□□□□ -1.63
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