RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 H3BT86 120 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 Q8N1Y9 231 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 COX7B2Q8TF08 81 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 SPTBN2O15020 2390 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 EML6Q6ZMW3 1958 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 MP68P56378 58 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 LGALS9O00182 355 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZUT4 128 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRM-211ENST00000580170 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 A0A087WW49 117 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 E7EUB6 86 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 CADP27708 2225 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 DAND5Q8N907 189 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC2BQ92478 149 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 ZMAT4Q9H898 229 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 ATP5G1P05496 136 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 ACACAQ13085 2346 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 CAMK2N2Q96S95 79 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 COX7A2LO14548 114 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 NOTCH4Q99466 2003 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 DEFB113Q30KQ7 82 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 E9PLD3 99 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 C9orf66Q5T8R8 295 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 CTRLP40313 264 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA12Q7Z6I5 190 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 NCKAP5O14513 1909 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 PIFOQ8TCI5 191 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV3-30P01768 117 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV3-33P01772 117 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 VSIG2Q96IQ7 327 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 MT-ATP8P03928 68 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
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PTPRM-211ENST00000580170 NREPQ16612 68 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 Q8N7P7 452 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00643Q86TS7 51 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 C11orf1Q9H5F2 150 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 C2orf70A6NJV1 201 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
PTPRM-211ENST00000580170 MED14OSP0DP75 135 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRM-211ENST00000580170 C10orf105Q8TEF2 133 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRM-211ENST00000580170 DEFB1P60022 68 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF503Q96F45 646 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV1-47P01700 117 aa16.39■□□□□ 0.21
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PTPRM-211ENST00000580170 C11orf86A6NJI1 115 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRM-211ENST00000580170 SEM1Q6ZVN7 128 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRM-211ENST00000580170 ODF1Q14990 250 aa16.38■□□□□ 0.21
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PTPRM-211ENST00000580170 ESM1Q9NQ30 184 aa16.38■□□□□ 0.21
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PTPRM-211ENST00000580170 K7EMT4 169 aa16.37■□□□□ 0.21
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PTPRM-211ENST00000580170 SPATA25Q9BR10 227 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRM-211ENST00000580170 C14orf132Q9NPU4 83 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRM-211ENST00000580170 C19orf71A6NCJ1 209 aa16.36■□□□□ 0.21
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PTPRM-211ENST00000580170 H3BQ85 93 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRM-211ENST00000580170 HHLA3Q9XRX5 114 aa16.34■□□□□ 0.21
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PTPRM-211ENST00000580170 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
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PTPRM-211ENST00000580170 SPTSSBQ8NFR3 76 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 COL4A3Q01955 1670 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 MDFICQ9P1T7 246 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 TRBV12-3P01733 135 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa16.3■□□□□ 0.2
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PTPRM-211ENST00000580170 RBX1P62877 108 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 SIRPDQ9H106 197 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 C4orf3Q8WVX3 66 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 MPLKIPQ8TAP9 179 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa16.29■□□□□ 0.2
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