RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479		H3BVH4	76 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	BCL2L11	O43521	198 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	SCO1	O75880	301 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	LTA	P01374	205 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	GAGE1	Q13065	139 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	GAGE4	Q13068	117 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	GAGE5	Q13069	117 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	GAGE13	Q4V321	117 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	TMUB2	Q71RG4	321 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	JPT2	Q9H910	190 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	BIN3	Q9NQY0	253 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		6.34	□□□□□ -1.39
KIFC3-231	ENST00000567479	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		6.33	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	PSCA	O43653	123 aa		6.33	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	6.33	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		6.33	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	SFRP2	Q96HF1	295 aa		6.33	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		6.32	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	RHOD	O00212	210 aa		6.32	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV3-30	P01768	117 aa		6.32	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV3-33	P01772	117 aa		6.32	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	S100A8	P05109	93 aa		6.32	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		6.32	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		6.32	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC01559	Q495D7	138 aa		6.32	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		6.32	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		6.32	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	BAGE2	Q86Y30	109 aa		6.32	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		6.32	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A087WWC5	75 aa		6.31	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A087WWL8	130 aa		6.31	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		6.31	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479		M0R381	172 aa		6.31	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	SNAPIN	O95295	136 aa		6.31	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	APOC3	P02656	99 aa		6.31	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	ZFP82	Q8N141	532 aa		6.31	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479		Q8N1X5	172 aa		6.31	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479		Q9HAA7	133 aa		6.31	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479		Q9UF83	564 aa		6.31	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479		F8W036	122 aa		6.3	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM6	P0DI80	62 aa		6.3	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00694	P0DN24	101 aa		6.3	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		6.3	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	MLST8	Q9BVC4	326 aa		6.3	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	TM2D2	Q9BX73	214 aa		6.3	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	RYR1	P21817	5038 aa		6.29	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		6.29	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	GCSH	P23434	173 aa		6.29	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB5C	P51148	216 aa		6.29	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	CCL20	P78556	96 aa		6.29	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		6.29	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	GNG13	Q9P2W3	67 aa		6.29	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	CXCL1	P09341	107 aa		6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP10-1	P60331	282 aa		6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB5B	P61020	215 aa		6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	LAGE3	Q14657	143 aa		6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	PRR27	Q6MZM9	219 aa		6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	C12orf57	Q99622	126 aa		6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		6.28	□□□□□ -1.4
KIFC3-231	ENST00000567479	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		6.27	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		6.27	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	SNAI2	O43623	268 aa		6.27	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	AKR1D1	P51857	326 aa		6.27	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	XG	P55808	180 aa		6.27	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB4B	P61018	213 aa		6.27	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	SST	P61278	116 aa		6.27	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		6.27	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479		Q8N3U1	123 aa		6.27	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479		Q8N814	137 aa		6.27	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		6.27	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	SEC11C	Q9BY50	192 aa		6.27	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	HSPG2	P98160	4391 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM218	A2RU14	115 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
KIFC3-231	ENST00000567479	S100A6	P06703	90 aa		6.26	□□□□□ -1.41

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