RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512107.5

MATR3-238, Transcript of matrin 3, human

TSL 4

Gene MATR3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-238	ENST00000512107	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-238	ENST00000512107	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-238	ENST00000512107	TENM2	Q9NT68	2774 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-238	ENST00000512107	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MATR3-238	ENST00000512107	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107		P0DMU3	169 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	FAM231A	P0DMU4	169 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	FAM231C	P0DMU5	169 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	EVI2A	P22794	236 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	CRYBA4	P53673	196 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	SYT8	Q8NBV8	401 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107		A8MWV9	139 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107		F2Z2F3	143 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	C3orf84	H3BNL1	204 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	APOC3	P02656	99 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	CACNG7	P62955	275 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	WDR73	Q6P4I2	378 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	FAM231B	A6NCW3	169 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	NUPR2	A6NF83	97 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	GAS8-AS1	O95177	125 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	MT-ND4L	P03901	98 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	TWIST1	Q15672	202 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	LYST	Q99698	3801 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107		A0A096LPF7	62 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107		A0A1B0GXF2	115 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	PPP1R2P9	O14990	202 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	NDUFA5	Q16718	116 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	RNF185	Q96GF1	192 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107		A0A1B0GUT8	65 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	PAX4	O43316	350 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	PRO0255	Q9UI72	69 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MATR3-238	ENST00000512107	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	NUDT3	O95989	172 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	MGP	P08493	103 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	LINC00694	P0DN24	101 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	GYPE	P15421	78 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	AP1S3	Q96PC3	154 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107		A0A087WWC5	75 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107		K7EQD1	137 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	RHEB	Q15382	184 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		10.07	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	RHOD	O00212	210 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	CAMP	P49913	170 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	RIG	Q13278	110 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	ZNF56	Q15929	161 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	AMN1	Q8IY45	258 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	SVBP	Q8N300	66 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	GATD1	Q8NB37	220 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	FAM210B	Q96KR6	192 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	YPEL4	Q96NS1	127 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	GAGE12J	A6NER3	117 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	SMKR1	H3BMG3	65 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107		M0QY20	66 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	TRGC1	P0CF51	173 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	RAB4A	P20338	218 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	RAB4B	P61018	213 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	GAGE1	Q13065	139 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	GAGE4	Q13068	117 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	GAGE5	Q13069	117 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	ESRG	Q1W209	222 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	GAGE13	Q4V321	117 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		10.05	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107		F5H697	171 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107		H3BNG1	76 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	CIDEA	O60543	219 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	IMMP2L	Q96T52	175 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	SNAPIN	O95295	136 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	RHOH	Q15669	191 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	BORCS7	Q96B45	105 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MATR3-238	ENST00000512107	SCO1	O75880	301 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MATR3-238	ENST00000512107	NCR2	O95944	276 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MATR3-238	ENST00000512107	SMIM17	P0DL12	118 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MATR3-238	ENST00000512107	HBB	P68871	147 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MATR3-238	ENST00000512107	SLA	Q13239	276 aa		10.02	□□□□□ -0.81

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