RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 TIRAPP58753 221 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 DNLZQ5SXM8 178 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 Q9HAA7 133 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 RYR1P21817 5038 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 UMAD1C9J7I0 102 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 CIDEAO60543 219 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 LELP1Q5T871 98 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 PRR27Q6MZM9 219 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 NFE4Q86UQ8 179 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 DERL1Q9BUN8 251 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 SSTP61278 116 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 BAGE2Q86Y30 109 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 SYT8Q8NBV8 401 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 SFRP2Q96HF1 295 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 MLST8Q9BVC4 326 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 GNG13Q9P2W3 67 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 KRTAP10-1P60331 282 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.09□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.09□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 PSCAO43653 123 aa7.09□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 HAMPP81172 84 aa7.09□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 WFDC2Q14508 124 aa7.09□□□□□ -1.27
NELFE-213ENST00000494956 RAB19A4D1S5 217 aa7.08□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 K7EP13 123 aa7.08□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 RHODO00212 210 aa7.08□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 GZMBP10144 247 aa7.08□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 XGP55808 180 aa7.08□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 ZFP82Q8N141 532 aa7.08□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 Q8N1X5 172 aa7.08□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.08□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 HSPG2P98160 4391 aa7.07□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.07□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 IGLV2-8P01709 118 aa7.07□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 SULT1A2P50226 295 aa7.07□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 Q6ZNX1 250 aa7.07□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 TCTE3Q8IZS6 198 aa7.07□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 MANBALQ9NQG1 85 aa7.07□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 LECT2O14960 151 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 SNAI2O43623 268 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 ZNF56Q15929 161 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 CENPWQ5EE01 88 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 C11orf52Q96A22 123 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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NELFE-213ENST00000494956 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 FAM229AH3BQW9 127 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 C1QBP02746 253 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 UBE2D3P61077 147 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 UBE2D2P62837 147 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 NIT1Q86X76 327 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.05□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 CXCL1P09341 107 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 OR5AL1P0C617 328 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 GCSHP23434 173 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 RAB5CP51148 216 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 Q8N814 137 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 TPPP3Q9BW30 176 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 KLK12Q9UKR0 248 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 A0A087WWC5 75 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 F5H697 171 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 BCL2P10415 239 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 RAB4BP61018 213 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 LAGE3Q14657 143 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 SLC51BQ86UW2 128 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 BAALCQ8WXS3 180 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 MED9Q9NWA0 146 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-213ENST00000494956 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.03□□□□□ -1.28
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