RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 USMG5Q96IX5 58 aa13.01□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa13□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATP6V0BQ99437 205 aa13□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HIVEP2P31629 2446 aa13□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa13□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM78Q5T7P6 136 aa13□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C10orf99Q6UWK7 81 aa13□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SMIM2Q9BVW6 85 aa13□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa12.99□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa12.99□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR11H12B2RN74 326 aa12.99□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3-11P01762 117 aa12.99□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR11H1Q8NG94 326 aa12.99□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR11H2Q8NH07 326 aa12.99□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UFC1Q9Y3C8 167 aa12.99□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CLPSL1A2RUU4 121 aa12.98□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PSMB8P28062 276 aa12.98□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ORMDL2Q53FV1 153 aa12.98□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AMTNQ6UX39 209 aa12.98□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa12.98□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A1B0GV72 72 aa12.98□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LY6G6DO95868 133 aa12.98□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPANXN1Q5VSR9 72 aa12.98□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TOMM6Q96B49 74 aa12.98□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ESM1Q9NQ30 184 aa12.98□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRBV12-3P01733 135 aa12.97□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARL3P36405 182 aa12.97□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q8N2B8 174 aa12.97□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.97□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SCGB2A2Q13296 93 aa12.96□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SCGB3A1Q96QR1 104 aa12.96□□□□□ -0.33
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM89A2RUT3 159 aa12.96□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa12.96□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C20orf78Q9BR46 151 aa12.96□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SRD5A1P18405 259 aa12.95□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa12.94□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C8orf86Q6ZUL3 223 aa12.94□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LENEPQ9Y5L5 61 aa12.94□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 U3KQE9 123 aa12.94□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NF1P21359 2839 aa12.93□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CYSLTR1Q9Y271 337 aa12.93□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa12.93□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 H3BVH4 76 aa12.93□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RASL10AQ92737 203 aa12.93□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa12.92□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A6NJY4 79 aa12.92□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ELANEP08246 267 aa12.92□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 INSL3P51460 131 aa12.92□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CFAP126Q5VTH2 177 aa12.92□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q6ZSV7 163 aa12.92□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 METTL26Q96S19 204 aa12.92□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 APOMO95445 188 aa12.91□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UBE2D1P51668 147 aa12.91□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FOXI1Q12951 378 aa12.91□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q6ZQT7 251 aa12.91□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa12.91□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa12.91□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HIVEP1P15822 2718 aa12.91□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AGRNO00468 2067 aa12.91□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 M0R381 172 aa12.91□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BAALCQ8WXS3 180 aa12.91□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRADC1Q9BSG0 188 aa12.91□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NDUFA4O00483 81 aa12.9□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa12.9□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MTURNQ8N3F0 131 aa12.9□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRR9Q5T870 116 aa12.9□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DPH3P1Q9H4G8 78 aa12.9□□□□□ -0.34
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa12.89□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa12.89□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRSS29PA6NIE9 313 aa12.89□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C2orf66Q6UXQ4 117 aa12.89□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RNF152Q8N8N0 203 aa12.89□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa12.88□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HILS1P60008 231 aa12.88□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF815PA8K554 130 aa12.88□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MED14OSP0DP75 135 aa12.88□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC01549A6NIU2 74 aa12.87□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PPP1R17O96001 155 aa12.87□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CKS1BP61024 79 aa12.87□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UBE2D3P61077 147 aa12.87□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UBE2D2P62837 147 aa12.87□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UBE2E2Q96LR5 201 aa12.87□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC00477Q96M19 166 aa12.87□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 INAFM1C9JVW0 142 aa12.87□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C16orf92Q96LL3 132 aa12.87□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CDIP1Q9H305 208 aa12.87□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAV21A0A0B4J279 112 aa12.86□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TSPAN13O95857 204 aa12.86□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CD7P09564 240 aa12.86□□□□□ -0.35
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LYRM7Q5U5X0 104 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms