RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRD-201ENST00000355233 PRSS57Q6UWY2 283 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 COL4A3Q01955 1670 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 CGB1A6NKQ9 187 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 RNF223E7ERA6 249 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 C1orf159Q96HA4 380 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRD-201ENST00000355233 I3L2K1 104 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRD-201ENST00000355233 C2orf70A6NJV1 201 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRD-201ENST00000355233 DIRC1Q969H9 104 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRD-201ENST00000355233 DAD1P61803 113 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.82□□□□□ -1.8
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PTPRD-201ENST00000355233 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.81□□□□□ -1.8
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PTPRD-201ENST00000355233 H3BPC8 53 aa3.81□□□□□ -1.8
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PTPRD-201ENST00000355233 PFN2P35080 140 aa3.8□□□□□ -1.8
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PTPRD-201ENST00000355233 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
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PTPRD-201ENST00000355233 NDUFS5O43920 106 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-201ENST00000355233 CXCL6P80162 114 aa3.79□□□□□ -1.8
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