RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000102754.10

Pkp4-202, Transcript of Plakophilin-4, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp4, Length 4,614 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Pseudopodium .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Plxna4Q80UG2 1893 aa14.61□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Rnf217D3YYI7 515 aa14.61□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Arl6ip6Q8BH07 226 aa14.61□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Ccdc198Q9CPZ1 294 aa14.61□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Olfr1192-ps1A0A1L1SRD7 309 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Il2raP01590 268 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Zfp36l2P23949 484 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Stac2Q8R1B0 408 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Stxbp6Q8R3T5 210 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Shisal2bQ9D1Y9 158 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 4931428L18RikQ9D4S9 127 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Josd1Q9DBJ6 202 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Hs3st3b1Q9QZS6 390 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Sumo3Q9Z172 110 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Tmem238lA0A1B0GS74 79 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Gm43517E9PYS1 339 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Pax9P47242 342 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Bsph2Q0Q236 131 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Rnf224Q3UIW8 156 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 B020031M17RikQ3UT11 173 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Cd200r1lQ6XJV6 249 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Trpt1Q8K3A2 249 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Slc25a20Q9Z2Z6 301 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 SftpcP21841 193 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Pate4Q09098 99 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 GfralQ6SJE0 393 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Dirc2Q8BFQ6 478 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Gpr35Q9ES90 307 aa14.6□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Trbv12-1A0A0B4J1H0 124 aa14.59□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Vmn1r119E9Q4H3 307 aa14.59□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Gm11110Q3U4K9 109 aa14.59□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Spred3Q6P6N5 408 aa14.59□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Gm10283Q8C3L5 117 aa14.59□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Q9DAA3 117 aa14.59□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Q497N7 227 aa14.59□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Cldn23Q9D7D7 296 aa14.59□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 AplnrQ9WV08 377 aa14.59□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Eml5Q8BQM8 1977 aa14.59□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Olfr1189A2AV11 306 aa14.59□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Olfr399Q7TRX3 311 aa14.59□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 MNCb-2875Q9DCB3 74 aa14.59□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Zfp977L7N2E7 438 aa14.58□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Trav15-1-dv6-1Q5R1D2 117 aa14.58□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 G0s2Q61585 103 aa14.58□□□□□ -0.07
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Ccl3P10855 92 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Smim6Q3U0I6 56 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Spint3Q3UW09 88 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Olfr263Q7TQT8 317 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 CrhQ8CIT0 187 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 AmtnQ9D3J8 213 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Tmem183Q9JJB9 375 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Gm42517A0A1Y7VLQ2 374 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 AdmP97297 184 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Slc25a47Q6IS41 310 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 St6galnac3Q9WUV2 305 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Igkv14-126A0A075B5K0 117 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Cdx4Q07424 282 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Tmem140Q8BGY5 185 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Tmem97Q8VD00 176 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Olfr491Q8VG06 310 aa14.58□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 D830044I16RikA0A1D5RM53 117 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Frrs1lB1AXV0 293 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Olfr918E9PVZ7 325 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Tmem170bP86050 132 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Dppa1Q810Y7 116 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Spsb4Q8R5B6 273 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Susd2Q9DBX3 820 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Igkv4-50A0A0B4J1J0 117 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Atp6v0cP63082 155 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Cma2Q91VB1 246 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Tex36Q9D5N9 219 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Tmem139E9PX92 214 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Prss32E9Q409 334 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Emp2O88662 172 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Defa3P28310 93 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Defa10P50708 93 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Defa15P50713 93 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Trdv2-2Q5R1A4 116 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Bud31Q6PGH1 103 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Vmn1r235Q8R297 328 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Bpifa5Q9CQX3 270 aa14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Srsf9Q9D0B0 222 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Defa37K9J724 93 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Dkk1O54908 272 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Defa5P28312 93 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Supt4h1aP63271 117 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Olfr965Q7TRA7 312 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Olfr482Q8VG03 323 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Olfr954Q9EQB6 314 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Olfr1369-ps1A0A140T8K7 317 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Siglec15A7E1W8 342 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 EppinQ9DA01 134 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 MpzP27573 248 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Vsig8Q6P3A4 417 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Vmn1r54Q9EPB8 315 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Wipf3P0C7L0 485 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Leprotl1Q9CQ74 131 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 1700008P02RikQ9DAJ8 175 aa14.56□□□□□ -0.08
Pkp4-202ENSMUST00000102754 Csrp2P97314 193 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.2 ms