Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Trbv12-1A0A0B4J1H0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Trbv12-1A0A0B4J1H0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trbv12-1A0A0B4J1H0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trbv12-1A0A0B4J1H0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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