Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAJ8

1700008P02Rik, MCG13911, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700008P02RikQ9DAJ8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
1700008P02RikQ9DAJ8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
1700008P02RikQ9DAJ8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
1700008P02RikQ9DAJ8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
1700008P02RikQ9DAJ8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700008P02RikQ9DAJ8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700008P02RikQ9DAJ8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700008P02RikQ9DAJ8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700008P02RikQ9DAJ8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700008P02RikQ9DAJ8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700008P02RikQ9DAJ8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
1700008P02RikQ9DAJ8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700008P02RikQ9DAJ8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700008P02RikQ9DAJ8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700008P02RikQ9DAJ8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700008P02RikQ9DAJ8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700008P02RikQ9DAJ8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
1700008P02RikQ9DAJ8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700008P02RikQ9DAJ8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700008P02RikQ9DAJ8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700008P02RikQ9DAJ8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700008P02RikQ9DAJ8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700008P02RikQ9DAJ8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700008P02RikQ9DAJ8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23■■□□□ 1.27
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
1700008P02RikQ9DAJ8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700008P02RikQ9DAJ8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
1700008P02RikQ9DAJ8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700008P02RikQ9DAJ8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700008P02RikQ9DAJ8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700008P02RikQ9DAJ8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700008P02RikQ9DAJ8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700008P02RikQ9DAJ8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700008P02RikQ9DAJ8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700008P02RikQ9DAJ8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700008P02RikQ9DAJ8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700008P02RikQ9DAJ8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700008P02RikQ9DAJ8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700008P02RikQ9DAJ8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700008P02RikQ9DAJ8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700008P02RikQ9DAJ8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700008P02RikQ9DAJ8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700008P02RikQ9DAJ8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700008P02RikQ9DAJ8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700008P02RikQ9DAJ8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700008P02RikQ9DAJ8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700008P02RikQ9DAJ8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
1700008P02RikQ9DAJ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700008P02RikQ9DAJ8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700008P02RikQ9DAJ8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700008P02RikQ9DAJ8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700008P02RikQ9DAJ8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700008P02RikQ9DAJ8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700008P02RikQ9DAJ8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700008P02RikQ9DAJ8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700008P02RikQ9DAJ8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700008P02RikQ9DAJ8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700008P02RikQ9DAJ8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700008P02RikQ9DAJ8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700008P02RikQ9DAJ8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700008P02RikQ9DAJ8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
1700008P02RikQ9DAJ8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700008P02RikQ9DAJ8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700008P02RikQ9DAJ8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700008P02RikQ9DAJ8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700008P02RikQ9DAJ8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700008P02RikQ9DAJ8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700008P02RikQ9DAJ8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700008P02RikQ9DAJ8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
1700008P02RikQ9DAJ8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1700008P02RikQ9DAJ8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
1700008P02RikQ9DAJ8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
1700008P02RikQ9DAJ8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1700008P02RikQ9DAJ8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1700008P02RikQ9DAJ8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms