Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Cldn23Q9D7D7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cldn23Q9D7D7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cldn23Q9D7D7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cldn23Q9D7D7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cldn23Q9D7D7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cldn23Q9D7D7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cldn23Q9D7D7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cldn23Q9D7D7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cldn23Q9D7D7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cldn23Q9D7D7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cldn23Q9D7D7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cldn23Q9D7D7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Cldn23Q9D7D7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cldn23Q9D7D7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cldn23Q9D7D7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cldn23Q9D7D7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cldn23Q9D7D7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cldn23Q9D7D7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cldn23Q9D7D7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cldn23Q9D7D7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cldn23Q9D7D7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cldn23Q9D7D7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cldn23Q9D7D7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cldn23Q9D7D7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cldn23Q9D7D7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cldn23Q9D7D7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cldn23Q9D7D7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cldn23Q9D7D7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cldn23Q9D7D7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cldn23Q9D7D7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cldn23Q9D7D7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cldn23Q9D7D7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cldn23Q9D7D7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cldn23Q9D7D7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cldn23Q9D7D7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cldn23Q9D7D7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cldn23Q9D7D7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cldn23Q9D7D7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cldn23Q9D7D7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cldn23Q9D7D7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cldn23Q9D7D7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cldn23Q9D7D7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cldn23Q9D7D7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cldn23Q9D7D7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cldn23Q9D7D7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cldn23Q9D7D7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cldn23Q9D7D7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cldn23Q9D7D7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cldn23Q9D7D7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn23Q9D7D7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cldn23Q9D7D7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cldn23Q9D7D7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cldn23Q9D7D7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cldn23Q9D7D7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cldn23Q9D7D7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cldn23Q9D7D7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn23Q9D7D7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cldn23Q9D7D7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn23Q9D7D7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn23Q9D7D7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cldn23Q9D7D7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn23Q9D7D7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn23Q9D7D7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cldn23Q9D7D7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn23Q9D7D7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn23Q9D7D7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn23Q9D7D7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn23Q9D7D7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn23Q9D7D7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn23Q9D7D7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn23Q9D7D7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn23Q9D7D7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn23Q9D7D7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn23Q9D7D7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn23Q9D7D7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn23Q9D7D7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn23Q9D7D7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cldn23Q9D7D7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cldn23Q9D7D7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn23Q9D7D7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn23Q9D7D7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn23Q9D7D7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn23Q9D7D7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn23Q9D7D7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn23Q9D7D7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn23Q9D7D7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn23Q9D7D7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn23Q9D7D7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn23Q9D7D7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn23Q9D7D7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn23Q9D7D7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn23Q9D7D7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn23Q9D7D7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn23Q9D7D7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn23Q9D7D7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn23Q9D7D7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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