RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 FMC1Q96HJ9 113 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 GNG13Q9P2W3 67 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 RAB19A4D1S5 217 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 K7EQD1 137 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 M0R036 132 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 PAX4O43316 350 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 PPT1P50897 306 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 PTH2Q96A98 100 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 PRO0255Q9UI72 69 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 C9JCJ5 164 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 AKR1C3P42330 323 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 RAB5CP51148 216 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 SLAQ13239 276 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 LINC01559Q495D7 138 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF876PQ49A33 203 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 ZFP69Q49AA0 526 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 UPK3BQ9BT76 320 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTA-207ENST00000558936 RYR1P21817 5038 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 H3BVH4 76 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 Q9H8V8 135 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 HSPG2P98160 4391 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 B4DEV8 164 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 ORM1P02763 201 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 PARLQ9H300 379 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 IL36BQ9NZH7 164 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 CRYGDP07320 174 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 LINC00694P0DN24 101 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 BCL2P10415 239 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 GYPEP15421 78 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 UBE2G1P62253 170 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 BAGE2Q86Y30 109 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 MANBALQ9NQG1 85 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 K7EN84 100 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 GZMBP10144 247 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 TNP2Q05952 138 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 CENPWQ5EE01 88 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 SNAI2O43623 268 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 NXPH4O95158 308 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 ASIPP42127 132 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 LINC00315P59091 139 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 C6orf223Q8N319 242 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 Q8N3U1 123 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTA-207ENST00000558936 C9JQL5 133 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 IGLC6P0CF74 106 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 SRIP30626 198 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 PRR27Q6MZM9 219 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 SFRP2Q96HF1 295 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 VAX2Q9UIW0 290 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 A0A087WWL8 130 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 A0A1W2PPQ1 181 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 SIVA1O15304 175 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 CIDEAO60543 219 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
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