RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM231BA6NCW3 169 aa7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 F2Z2F3 143 aa7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GNRH2O43555 120 aa7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EMP1P54849 157 aa7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TCL1AP56279 114 aa7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYT8Q8NBV8 401 aa7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL36BQ9NZH7 164 aa7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 V9GYV3 84 aa7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 X6R8D5 127 aa7.42□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.41□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM229AH3BQW9 127 aa7.41□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GZMBP10144 247 aa7.41□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNLZQ5SXM8 178 aa7.41□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.41□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZFP82Q8N141 532 aa7.41□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.41□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.41□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIGD1CA8MV81 97 aa7.4□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 M0R2P5 195 aa7.4□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR5AL1P0C617 328 aa7.4□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.4□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AZU1P20160 251 aa7.4□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CACNG7P62955 275 aa7.4□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BTF3L4Q96K17 158 aa7.4□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IMMP2LQ96T52 175 aa7.4□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MDFICQ9P1T7 246 aa7.4□□□□□ -1.22
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CXorf65A6NEN9 183 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LYRM9A8MSI8 78 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 M0R381 172 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRM2P04554 102 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTRLP40313 264 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q8NAQ8 132 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C9orf85Q96MD7 179 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A1B0GUT8 65 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SNAI2O43623 268 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 S100A8P05109 93 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGLC6P0CF74 106 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RIGQ13278 110 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF876PQ49A33 203 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AP1S3Q96PC3 154 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.38□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A1B0GW15 77 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DEFB4AO15263 64 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRGC1P0CF51 173 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMIM17P0DL12 118 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SSTP61278 116 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DAD1P61803 113 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TWIST1Q15672 202 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WDR73Q6P4I2 378 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CFAP161Q6P656 301 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NUP35Q8NFH5 326 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GTSF1Q8WW33 167 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.37□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A0J9YWU9 116 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A8MWV9 139 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPINK4O60575 86 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DEFB130BP0DP73 79 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DEFB130AP0DP74 79 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL17DQ8TAD2 202 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTH2Q96A98 100 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 U3KQK5 164 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.36□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GAGE12BA1L429 117 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GAGE7O76087 117 aa7.35□□□□□ -1.23
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NXPH4O95158 308 aa7.35□□□□□ -1.23
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