RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 NAT8BQ9UHF3 227 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 FNDC10F2Z333 226 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 APCSP02743 223 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 DMRT1Q9Y5R6 373 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 CENPWQ5EE01 88 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 DPPA3Q6W0C5 159 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 NFE4Q86UQ8 179 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 ZANQ9Y493 2812 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PRE2 83 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS46E5RG02 174 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 H3BQ15 152 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 PKIAP61925 76 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 RAB19A4D1S5 217 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 PRM2P04554 102 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 FMC1Q96HJ9 113 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 CSMD2Q7Z408 3487 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 SS18Q15532 418 aa3.28□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 RNF152Q8N8N0 203 aa3.28□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM37Q8WXS4 190 aa3.28□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 ST20Q9HBF5 79 aa3.28□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00862A6NCI5 91 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PRAC2D3DTV9 90 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TCAPO15273 167 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2BP63146 152 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 THAP8Q8NA92 274 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 GTSF1Q8WW33 167 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 OVOL2Q9BRP0 275 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 DERL1Q9BUN8 251 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 SCO2A0A1W2PP80 73 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 SCO1O75880 301 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 NXPH4O95158 308 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 GZMBP10144 247 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRC-201ENST00000348564 Q8N1Y9 231 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087WWC5 75 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRC-201ENST00000348564 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRC-201ENST00000348564 SH2D1AO60880 128 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-201ENST00000348564 G0S2P27469 103 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 CKS1BP61024 79 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PRR20EP86478 221 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PRR20CP86479 221 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PRR20DP86480 221 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-201ENST00000348564 PRR20AP86496 221 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-201ENST00000348564 C12orf57Q99622 126 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV2A0A0B4J234 112 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 J3QL48 77 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-201ENST00000348564 POM121L12Q8N7R1 296 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 Q9H8V8 135 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS29PA6NIE9 313 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF726P1Q15940 193 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-201ENST00000348564 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 MYOZ3Q8TDC0 251 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 MBD3L1Q8WWY6 194 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 MRAP2Q96G30 205 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC17A3O00476 420 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R2P9O14990 202 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF580Q9UK33 172 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GUT8 65 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 STAG3L2P0CL84 134 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 STAG3L3P0CL85 134 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-201ENST00000348564 CACNG7P62955 275 aa3.25□□□□□ -1.89
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