RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 TDRG1Q3Y452 100 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM159AQ6UWV7 190 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 INSP01308 110 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 GZMBP10144 247 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 OXLD1Q5BKU9 147 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB125Q8N687 156 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB5AP20339 215 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 FXYD7P58549 80 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 COX19Q49B96 90 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 DNLZQ5SXM8 178 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZQT7 251 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF575Q86XF7 245 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 NAGKQ9UJ70 344 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLC6P0CF74 106 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 RASL11AQ6T310 242 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 Q8N1Y9 231 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 F2Z2F3 143 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 BORCS7Q96B45 105 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 PGLYRP4Q96LB8 373 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 CTRLP40313 264 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 MUC21Q5SSG8 566 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM256Q8N2U0 113 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 SRD5A3Q9H8P0 318 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 MED14OSP0DP75 135 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00467Q9BRT7 94 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GUT8 65 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 GRIFINA4D1Z8 144 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 ASIPP42127 132 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5AL1P0C617 328 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GW15 77 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 LYZL1Q6UWQ5 148 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CNFNQ9BYD5 112 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 XCL2Q9UBD3 114 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SNAI2O43623 268 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 RIGQ13278 110 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR73Q6P4I2 378 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 RBMY1CP0DJD4 496 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 S100A4P26447 101 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS10P46783 165 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SAMD5Q5TGI4 173 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TRGV11A0A075B6L2 103 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 SPINK4O60575 86 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 S100A8P05109 93 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 TPPP3Q9BW30 176 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CSTL1Q9H114 145 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ANK2Q01484 3957 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GXF2 115 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 HBBP68871 147 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 GNB1LQ9BYB4 327 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 MT-ND6P03923 174 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DL5AQ8N109 375 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 GNRH2O43555 120 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 ARMS2P0C7Q2 107 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 KRTAP10-11P60412 298 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC01587Q99440 93 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNG7P62955 275 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BVH4 76 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM208Q9BTX3 173 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SCRT2Q9NQ03 307 aa22.63■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 G3V4G9 280 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-DQA1P01909 254 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 APOC4P55056 127 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf158Q8N1D5 194 aa22.62■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 CBY3A6NI87 242 aa22.61■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 MUC4Q99102 2169 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 A8MZ25 164 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 SNURFLB1AK76 121 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 GATD1Q8NB37 220 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa22.6■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 CAMPP49913 170 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM136Q6ZRR5 245 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf85Q96MD7 179 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa22.59■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 CMYA5Q8N3K9 4069 aa22.58■■□□□ 1.21
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa22.58■■□□□ 1.2
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