RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 IMUPQ9GZP8 106 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM57BQ71RH2 274 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 DRAM1Q8N682 238 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 GPHA2Q96T91 129 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 V9GY05 133 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 FREM1Q5H8C1 2179 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 IZUMO1RA6ND01 250 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 H3BP45 60 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF823P16415 610 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 DCANP1Q8TF63 244 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 C4orf45Q96LM5 186 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR13Q9NZ81 148 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.53□□□□□ -1.84
RABGGTB-213ENST00000496055 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 J3QRE1 110 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 PDCD6O75340 191 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 GYPBP06028 91 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 FXYD6P3P58550 94 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 NPC2P61916 151 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 SS18Q15532 418 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.853e-7■■■■■ 51.1
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00305Q7Z4B0 112 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 SPTSSAQ969W0 71 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 SYNGR2O43760 224 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF32P17041 273 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.852e-11■■■■■ 53.8
RABGGTB-213ENST00000496055 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM27BQ5VT28 67 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 ALPK2Q86TB3 2170 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 CADP27708 2225 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 ATRQ13535 2644 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 VSIG8P0DPA2 414 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 LMO4P61968 165 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 C10orf128Q5T292 105 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 EPDR1Q9UM22 224 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV1-46P01743 117 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 PAX8Q06710 450 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 IL36BQ9NZH7 164 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 F6UB75 175 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 HLA-DOBP13765 273 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMB2P49721 201 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 HERVK_113P61574 105 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF56Q15929 161 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 MLANAQ16655 118 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR86Q86TI4 376 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 COL6A5A8TX70 2615 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 LGALS9O00182 355 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 PATE4P0C8F1 98 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 ECSCRQ19T08 205 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 ORMDL2Q53FV1 153 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 OR10AC1Q8NH08 325 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 RFESDQ8TAC1 157 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM230Q96A57 120 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 FXYD5Q96DB9 178 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF503Q96F45 646 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 STAB1Q9NY15 2570 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 CLPSL1A2RUU4 121 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 LEPROTL1O95214 131 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 MGST1P10620 155 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC01545Q5VT33 79 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 Q6ZS49 121 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 MYOZ3Q8TDC0 251 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 ITLN1Q8WWA0 313 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 NMNAT3Q96T66 252 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 UPK3BQ9BT76 320 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 PGPA6NDG6 321 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 J3QLW9 94 aa3.5□□□□□ -1.85
RABGGTB-213ENST00000496055 PIN1P1O15428 100 aa3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 150 ms