RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411265.1

RNU6-1001P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1001, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1001P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CCKP06307 115 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NMBP08949 121 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RBM3P98179 157 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRPM7Q96QT4 1865 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FGD6Q6ZV73 1430 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IFITM5A6NNB3 132 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 H7BYZ3 331 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BCL2P10415 239 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SDC4P31431 198 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CLEC2BQ92478 149 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CHD6Q8TD26 2715 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 APC2O95996 2303 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-0.8□□□□□ -2.54
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 CD109Q6YHK3 1445 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MUC17Q685J3 4493 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ABCA1O95477 2261 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IGKCP01834 107 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IL7P13232 177 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SPRR2BP35325 72 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR5H6Q8NGV6 325 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AP3S1Q92572 193 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM141Q96I45 108 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TAF9BQ9HBM6 251 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BET1LQ9NYM9 111 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PKHD1P08F94 4074 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CPDO75976 1380 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AKAP13Q12802 2813 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CSMD3Q7Z407 3707 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CADP27708 2225 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MED13LQ71F56 2210 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ATG12O94817 140 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ERVS71-1P61550 626 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SMIM7Q9BQ49 75 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NINQ8N4C6 2090 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ATRQ13535 2644 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NUP210LQ5VU65 1888 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EDF1O60869 148 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 FABP2P12104 132 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MAXP61244 160 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EMX2Q04743 252 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BORCS8Q96FH0 119 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRELID3AQ96N28 172 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OTORQ9NRC9 128 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ITPR1Q14643 2758 aa-0.83□□□□□ -2.54
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 PIK3C2AO00443 1686 aa-0.84□□□□□ -2.54
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 SMIM11BQ8TCY0 68 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PARVGQ9HBI0 331 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LRTM1Q9HBL6 345 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FKBP11Q9NYL4 201 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ANK1P16157 1881 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-0.85□□□□□ -2.54
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
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RNU6-1001P-201ENST00000411265 CTXN2P0C2S0 81 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LAMA1P25391 3075 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ARF6P62330 175 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1001P-201ENST00000411265 REEP5Q00765 189 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AKAP6Q13023 2319 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1001P-201ENST00000411265 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR5A2Q8NGI9 324 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CARD19Q96LW7 228 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRAV17A0A0B4J275 112 aa-0.86□□□□□ -2.55
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