RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 XKRY2A2RUG3 117 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 KCNIP4Q6PIL6 250 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 C1orf196B1AJZ1 125 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 RBMY1CP0DJD4 496 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 RPS20P60866 119 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 FAM159AQ6UWV7 190 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 GRIFINA4D1Z8 144 aa16■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa16■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 IMMP2LQ96T52 175 aa16■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 NEU1Q99519 415 aa16■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 DNAH3Q8TD57 4116 aa16■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM208Q9BTX3 173 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 TPPP3Q9BW30 176 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 CSTL1Q9H114 145 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 A0A1W2PPQ1 181 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 HIGD1CA8MV81 97 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 GTSF1Q8WW33 167 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 GFRA4Q9GZZ7 299 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 ELOBQ15370 118 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 KCNS1Q96KK3 526 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 C20orf144Q9BQM9 153 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 NAT8BQ9UHF3 227 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 HTN1P15515 57 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 LINC01587Q99440 93 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 RAB5AP20339 215 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF575Q86XF7 245 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 PGLYRP4Q96LB8 373 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXA4-201ENST00000360046 FAM231BA6NCW3 169 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 GNRH2O43555 120 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 SPINK4O60575 86 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 APOC4P55056 127 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 NUP35Q8NFH5 326 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 CBY3A6NI87 242 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 TYMSP04818 313 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 S100A4P26447 101 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 ASIPP42127 132 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 TDRG1Q3Y452 100 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 C1orf158Q8N1D5 194 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 PYGO2Q9BRQ0 406 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM256Q8N2U0 113 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 YPEL4Q96NS1 127 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 CXCL1P09341 107 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 KIR2DL5AQ8N109 375 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 H3BVH4 76 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 LYZL1Q6UWQ5 148 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 BTF3L4Q96K17 158 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 S100A6P06703 90 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 IGLC6P0CF74 106 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 TRGV11A0A075B6L2 103 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 MUC21A0A140T8X8 626 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 PRM2P04554 102 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 LINC00518Q8N0U6 118 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 SSTP61278 116 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 BORCS7Q96B45 105 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXA4-201ENST00000360046 ARMS2P0C7Q2 107 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 CTRLP40313 264 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 FAM210BQ96KR6 192 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 A8MZ25 164 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 DEFB121Q5J5C9 76 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 LINC00467Q9BRT7 94 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 A0A1B0GUT8 65 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 F2Z2F3 143 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 DEFB135Q30KP9 77 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 DNLZQ5SXM8 178 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 MDFICQ9P1T7 246 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 K7EIL1 84 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 C5orf52A6NGY3 159 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXA4-201ENST00000360046 UBE2CO00762 179 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms