RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
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C9orf3-214ENST00000473778 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.45□□□□□ -1.06
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C9orf3-214ENST00000473778 LEPP41159 167 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 NMUP48645 174 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 PRR9Q5T870 116 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 J3QR89 54 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-214ENST00000473778 ODF1Q14990 250 aa8.37□□□□□ -1.07
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