RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 S4R3C0 116 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 RGS5O15539 181 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 HLA-DQB1P01920 261 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 LINC00614P0C842 121 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 MIFP14174 115 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 HLA-DMBP28068 263 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 OPRK1P41145 380 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 CCDC58Q4VC31 144 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 Q56UQ5 140 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 IDO2Q6ZQW0 420 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 OR8A1Q8NGG7 326 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 DERL3Q96Q80 235 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 VSIRQ9H7M9 311 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 C21orf62Q9NYP8 219 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 APLNQ9ULZ1 77 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 AGRNO00468 2067 aa3.54□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 PANO1I0J062 215 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 ARL6IP5O75915 188 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 IGKV1-39P01597 117 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 IGKV1D-39P04432 117 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 CD5P06127 495 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 RPL12P30050 165 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 H2BFSP57053 126 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 CDK10Q15131 360 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 LUZP6Q538Z0 58 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 SLC25A46Q96AG3 418 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 GINS3Q9BRX5 216 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 COMMD5Q9GZQ3 224 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 RABAC1Q9UI14 185 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.53□□□□□ -1.84
CCL20-201ENST00000358813 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 OR2T8A6NH00 312 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 HRASP01112 189 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 SEC11BP0C7V7 166 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 HTN3P15516 51 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 GADD45AP24522 165 aa3.52□□□□□ -1.85
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CCL20-201ENST00000358813 MP68P56378 58 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 GNGT1P63211 74 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 BTN1A1Q13410 526 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 PPP1R1AQ13522 171 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 CENPWQ5EE01 88 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 FRZBQ92765 325 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 MARVELD1Q9BSK0 173 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 CCDC90BQ9GZT6 254 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 TMEM14BQ9NUH8 114 aa3.52□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 A0A1B0GVY2 172 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 A0A1B0GW64 132 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 TMEM250H0YL14 139 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 NDUFA4O00483 81 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 CXorf1O96002 111 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 REG1AP05451 166 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 EMP1P54849 157 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 ARPC4P59998 168 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 FAM222AQ5U5X8 452 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 COMMD7Q86VX2 200 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 AK3Q9UIJ7 227 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 AP4S1Q9Y587 144 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 ALG5Q9Y673 324 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.51□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa3.5□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa3.5□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 TMEM189A5PLL7 270 aa3.5□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 J3QRK9 145 aa3.5□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 RTL8CO15255 209 aa3.5□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 SPART-AS1P0CW21 52 aa3.5□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.5□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 DEFB131AP59861 70 aa3.5□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 RAB2AP61019 212 aa3.5□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 DAD1P61803 113 aa3.5□□□□□ -1.85
CCL20-201ENST00000358813 CATR1Q13166 79 aa3.5□□□□□ -1.85
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