RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449		I3L2K1	104 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	PTPRB	P23467	1997 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	VWC2L	B2RUY7	222 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	LTA	P01374	205 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	UCN	P55089	124 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	ACAN	P16112	2415 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	JKAMP	Q9P055	326 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449		K7EMI3	77 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	HBD	P02042	147 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	PAX1	P15863	534 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	EMP1	P54849	157 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ACSS3-208	ENST00000616449		H3BRN7	92 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	NPY	P01303	97 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	PRAC2	D3DTV9	90 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	LINC01548	A6NM66	108 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449		H3BUX3	64 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	JMJD1C	Q15652	2540 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449		A6NDN8	102 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	RASL11A	Q6T310	242 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	PRR25	Q96S07	402 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	RELN	P78509	3460 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	PET117	Q6UWS5	81 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		10	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449		F6UB75	175 aa		10	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449		H7C2G1	150 aa		10	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	TGFA	P01135	160 aa		10	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		10	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	CCL19	Q99731	98 aa		10	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	MBD6	Q96DN6	1003 aa		10	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	PAX8	Q06710	450 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	ST20	Q9HBF5	79 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	HIST1H4G	Q99525	98 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF492	Q9P255	531 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	PSMB11	A5LHX3	300 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	NRGN	Q92686	78 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	JMJD8	Q96S16	334 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	NPFF	O15130	113 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	DKK2	Q9UBU2	259 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	MTURN	Q8N3F0	131 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	FOXE3	Q13461	319 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449		Q6AWC8	147 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	COX11	Q9Y6N1	276 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF688	P0C7X2	276 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	EFNA4	P52798	201 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449		M0R1W7	72 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	CRYGC	P07315	174 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	CTSG	P08311	255 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		9.96	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	OVOL3	O00110	214 aa		9.96	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		9.96	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		9.96	□□□□□ -0.81
ACSS3-208	ENST00000616449	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		9.96	□□□□□ -0.81

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