RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM231BA6NCW3 169 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 IGFBPL1Q8WX77 278 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 HIVEP2P31629 2446 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 PRR25Q96S07 402 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 CT83Q5H943 113 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM14CQ9P0S9 112 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 NAV2Q8IVL1 2488 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 TRAV2A0A0B4J234 112 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 NDUFA4O00483 81 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 SPINK13Q1W4C9 94 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF491Q8N8L2 437 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 OR2K2Q8NGT1 345 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 ORAOV1Q8WV07 137 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 FXYD5Q96DB9 178 aa16.42■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 J3QKU1 62 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 MALP21145 153 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 C10orf91Q5T1B1 145 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 J3QLI3 93 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 PRADC1Q9BSG0 188 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 V9GYV3 84 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 TNCP24821 2201 aa16.41■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 C18orf32Q8TCD1 76 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 C11orf52Q96A22 123 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 DENND4AQ7Z401 1863 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF114Q9Y508 228 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 TNFRSF6BO95407 300 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 PLNP26678 52 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 Q0VG73 95 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 GUSBP1Q15486 140 aa16.4■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.22
PTPRJ-208ENST00000615445 CENPFP49454 3210 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A087WX48 190 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 OR11H6Q8NGC7 330 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 ADORA2A-AS1P86434 159 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM231DQ6ZW35 169 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 XCL2Q9UBD3 114 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 MSMPQ1L6U9 139 aa16.39■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 LINC01619G3V211 115 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 SPOCK3Q9BQ16 436 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 TDGF1P3P51864 188 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 HSD52Q0P140 79 aa16.38■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 KNCNA6PVL3 124 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM104BQ5XKR9 115 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 OR9G4Q8NGQ1 327 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 ASPHD1Q5U4P2 390 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 PRSS46E5RG02 174 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 VWC2Q2TAL6 325 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 A8MWP6 167 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF664Q8N3J9 261 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 LYPD6BQ8NI32 183 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 TEX43Q6ZNM6 134 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 C1orf159Q96HA4 380 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 MYO9AB2RTY4 2548 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 PRB1P04280 392 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 SCGB1A1P11684 91 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 SLAQ13239 276 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 C17orf77Q96MU5 243 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 SEC11AP67812 179 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 KLK9Q9UKQ9 250 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 DEFB112Q30KQ8 113 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 Q8NA96 180 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 IGHV4-59P01825 116 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 VGLL1Q99990 258 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 DEFB130BP0DP73 79 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 DEFB130AP0DP74 79 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5A1Q8NGJ0 315 aa16.33■□□□□ 0.21
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCA2Q9BZC7 2435 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 DTX2Q86UW9 622 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 MED12LQ86YW9 2145 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM131Q92545 1883 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 CRPP02741 224 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 RITA1Q96K30 269 aa16.33■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A087X0K7 114 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 IGHV4-39P01824 125 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 Q71RC1 249 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 ELANEP08246 267 aa16.32■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 PRSS57Q6UWY2 283 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 MPV17L2Q567V2 206 aa16.31■□□□□ 0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF479Q96JC4 524 aa16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms