RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321356.8

CLK1-201, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLK1, Length 1,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-201ENST00000321356 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.75□□□□□ -1.33
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CLK1-201ENST00000321356 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.74□□□□□ -1.33
CLK1-201ENST00000321356 RBAKDNA6NC62 111 aa6.74□□□□□ -1.33
CLK1-201ENST00000321356 CBY3A6NI87 242 aa6.74□□□□□ -1.33
CLK1-201ENST00000321356 SMKR1H3BMG3 65 aa6.74□□□□□ -1.33
CLK1-201ENST00000321356 TMEM11P17152 192 aa6.74□□□□□ -1.33
CLK1-201ENST00000321356 PCP4P48539 62 aa6.74□□□□□ -1.33
CLK1-201ENST00000321356 NHLH1Q02575 133 aa6.74□□□□□ -1.33
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CLK1-201ENST00000321356 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.74□□□□□ -1.33
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CLK1-201ENST00000321356 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.73□□□□□ -1.33
CLK1-201ENST00000321356 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.73□□□□□ -1.33
CLK1-201ENST00000321356 PIFOQ8TCI5 191 aa6.73□□□□□ -1.33
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CLK1-201ENST00000321356 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.73□□□□□ -1.33
CLK1-201ENST00000321356 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.72□□□□□ -1.33
CLK1-201ENST00000321356 HSD52Q0P140 79 aa6.72□□□□□ -1.33
CLK1-201ENST00000321356 C15orf32Q32M92 178 aa6.72□□□□□ -1.33
CLK1-201ENST00000321356 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.72□□□□□ -1.33
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CLK1-201ENST00000321356 ZMAT4Q9H898 229 aa6.72□□□□□ -1.33
CLK1-201ENST00000321356 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CLK1-201ENST00000321356 RELNP78509 3460 aa6.71□□□□□ -1.33
CLK1-201ENST00000321356 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.71□□□□□ -1.33
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CLK1-201ENST00000321356 H3BRM9 83 aa6.71□□□□□ -1.34
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CLK1-201ENST00000321356 A6NDN8 102 aa6.7□□□□□ -1.34
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CLK1-201ENST00000321356 ODF1Q14990 250 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.7□□□□□ -1.34
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CLK1-201ENST00000321356 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 NBASA2RRP1 2371 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 C9orf118A6NHY6 69 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 ATP6V0E1O15342 81 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 GOSR1O95249 250 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 CLEC3BP05452 202 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 LEPP41159 167 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 UBE2E1P51965 193 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 PCP2Q8IVA1 136 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 RNF182Q8N6D2 247 aa6.7□□□□□ -1.34
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CLK1-201ENST00000321356 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.7□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 IGF2RP11717 2491 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 GAGE12BA1L429 117 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 PRSS47A8MTI9 375 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 ECSCRQ19T08 205 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 Q8N8P6 123 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 JMJD8Q96S16 334 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 U3KQE9 123 aa6.69□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 A0A1W2PPR1 153 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 UQCRFS1P47985 274 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 KIR3DS1Q14943 382 aa6.68□□□□□ -1.34
CLK1-201ENST00000321356 C18orf15Q96N68 181 aa6.68□□□□□ -1.34
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