RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 SMIM7Q9BQ49 75 aa3.16□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3.16□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 GGTLC1Q9BX51 225 aa3.16□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 COMMD5Q9GZQ3 224 aa3.16□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB1BQ9H0U4 201 aa3.16□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM133Q9H2Q1 129 aa3.16□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 WASHC3Q9Y3C0 194 aa3.16□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 PXMP4Q9Y6I8 212 aa3.16□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 PLCE1Q9P212 2302 aa3.16□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 APC2O95996 2303 aa3.15□□□□□ -1.9
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 C11orf94C9JXX5 98 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 CLDN34H7C241 214 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 PDE6DO43924 150 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF253O75346 499 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 CXorf1O96002 111 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV1-16P04430 117 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLL1P15814 213 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 S100PP25815 95 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 MAS1LP35410 378 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 LGALS7P47929 136 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 REG1BP48304 166 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.912e-6■■■□□ 18.2
CAPNS1-210ENST00000590211 DLX6P56179 175 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 SLAQ13239 276 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ADIRFQ15847 76 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM241Q24JQ0 296 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 BSXQ3C1V8 233 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 MIC13Q5XKP0 118 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFP82Q8N141 532 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 Q8N7P7 452 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 CBLN4Q9NTU7 201 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM242Q9NWH2 141 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNRD1Q9P1U0 126 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 NAV3Q8IVL0 2385 aa3.15□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM231BA6NCW3 169 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 H7BYZ3 331 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ENSAO43768 121 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 YIF1AO95070 293 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 S100A8P05109 93 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ARL14EPLP0DKL9 152 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 COL8A2P25067 703 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS10P46783 165 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP5G3P48201 142 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 AKR1D1P51857 326 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 RND2P52198 227 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS2R45P59539 299 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 PAX8Q06710 450 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ELOBQ15370 118 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 SPNS3Q6ZMD2 512 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC16A13Q7RTY0 426 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R27Q86WC6 154 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 Q8WTZ3 238 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 CACNG8Q8WXS5 425 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 C22orf15Q8WYQ4 148 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 BTF3L4Q96K17 158 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 YPEL4Q96NS1 127 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5B12Q96R08 314 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 C19orf24Q9BVV8 132 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 RETNQ9HD89 108 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 DPM3Q9P2X0 92 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 FUT9Q9Y231 359 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 CENPEQ02224 2701 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 FLNCQ14315 2725 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ICE1Q9Y2F5 2266 aa3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 ITPR2Q14571 2701 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.13□□□□□ -1.91
CAPNS1-210ENST00000590211 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.13□□□□□ -1.91
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