Protein–RNA interactions for Protein: Q30154

HLA-DRB5, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB5Q30154 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLA-DRB5Q30154 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HLA-DRB5Q30154 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HLA-DRB5Q30154 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HLA-DRB5Q30154 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HLA-DRB5Q30154 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HLA-DRB5Q30154 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HLA-DRB5Q30154 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLA-DRB5Q30154 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DRB5Q30154 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-DRB5Q30154 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLA-DRB5Q30154 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HLA-DRB5Q30154 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HLA-DRB5Q30154 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DRB5Q30154 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-DRB5Q30154 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DRB5Q30154 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DRB5Q30154 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DRB5Q30154 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HLA-DRB5Q30154 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-DRB5Q30154 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLA-DRB5Q30154 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLA-DRB5Q30154 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DRB5Q30154 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HLA-DRB5Q30154 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DRB5Q30154 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DRB5Q30154 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DRB5Q30154 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DRB5Q30154 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DRB5Q30154 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DRB5Q30154 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DRB5Q30154 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-DRB5Q30154 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-DRB5Q30154 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DRB5Q30154 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DRB5Q30154 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DRB5Q30154 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DRB5Q30154 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DRB5Q30154 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DRB5Q30154 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DRB5Q30154 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DRB5Q30154 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DRB5Q30154 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DRB5Q30154 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-DRB5Q30154 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-DRB5Q30154 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-DRB5Q30154 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-DRB5Q30154 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DRB5Q30154 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DRB5Q30154 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DRB5Q30154 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DRB5Q30154 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DRB5Q30154 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DRB5Q30154 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HLA-DRB5Q30154 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DRB5Q30154 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DRB5Q30154 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DRB5Q30154 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DRB5Q30154 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DRB5Q30154 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DRB5Q30154 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DRB5Q30154 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-DRB5Q30154 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DRB5Q30154 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DRB5Q30154 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DRB5Q30154 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DRB5Q30154 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DRB5Q30154 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DRB5Q30154 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DRB5Q30154 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DRB5Q30154 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DRB5Q30154 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DRB5Q30154 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DRB5Q30154 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DRB5Q30154 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DRB5Q30154 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DRB5Q30154 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DRB5Q30154 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DRB5Q30154 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DRB5Q30154 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRB5Q30154 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DRB5Q30154 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DRB5Q30154 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HLA-DRB5Q30154 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DRB5Q30154 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DRB5Q30154 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DRB5Q30154 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DRB5Q30154 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-DRB5Q30154 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DRB5Q30154 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DRB5Q30154 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-DRB5Q30154 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-DRB5Q30154 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-DRB5Q30154 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HLA-DRB5Q30154 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLA-DRB5Q30154 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DRB5Q30154 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLA-DRB5Q30154 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DRB5Q30154 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLA-DRB5Q30154 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms