RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 LRRK2Q5S007 2527 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 C2orf16Q68DN1 1984 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 CD59P13987 128 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 KLF12Q9Y4X4 402 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 D6R8Y8 96 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 ZFAND6Q6FIF0 208 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 OCC1Q8TAD7 63 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 RCHY1Q96PM5 261 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 PRTN3P24158 256 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 GAS1P54826 345 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 DMRTA1Q5VZB9 504 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 Q86TA4 180 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 LCN12Q6JVE5 192 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 GAFA1Q96PS6 74 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 S4R3C0 116 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 RMI2Q96E14 147 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 MUC21Q5SSG8 566 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF492Q9P255 531 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 FAM201AQ5SY85 155 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 H3BUA1 57 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 HTN3P15516 51 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 SS18Q15532 418 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 Q6ZS92 163 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 SIGLEC9Q9Y336 463 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 EGR1P18146 543 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 UBE2E1P51965 193 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM14BQ9NUH8 114 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 K7EMI3 77 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF562Q6V9R5 426 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 LINC00158P58513 81 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 C8orf31Q8N9H6 132 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 CLPSP04118 112 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 FOXF2Q12947 444 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 GZMBP10144 247 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 CD33P20138 364 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PRX2 142 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 RNF152Q8N8N0 203 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 LINC01545Q5VT33 79 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 IGKV1D-12P01611 117 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV4-39P01824 125 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM95Q3KNT9 176 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 GFI1Q99684 422 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 SIGMAR1Q99720 223 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 IGF2RP11717 2491 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0A6YYD4 124 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 Q6P435 159 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 CD177Q8N6Q3 437 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 H3BUX3 64 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 TDGF1P3P51864 188 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 NUP35Q8NFH5 326 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 SRD5A1P18405 259 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 H0YIZ8 118 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 HGFACQ04756 655 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 MSRB2Q9Y3D2 182 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0G2JNJ9 132 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 PAX4O43316 350 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 LMO1P25800 156 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 Q9UFV3 132 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 IGKV1-5P01602 117 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 GAGE2BQ13066 116 aa4.9□□□□□ -1.62
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PTPRT-201ENST00000356100 PRDM6Q9NQX0 595 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 PSCAO43653 123 aa4.9□□□□□ -1.62
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PTPRT-201ENST00000356100 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF329Q86UD4 541 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 LINC00311Q8N616 119 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 ALPK3Q96L96 1907 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRT-201ENST00000356100 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 APOC4P55056 127 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.9□□□□□ -1.63
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