RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 CFC1BP0CG36 223 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRO-201ENST00000281171 CFC1P0CG37 223 aa11.68□□□□□ -0.54
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PTPRO-201ENST00000281171 RNF5Q99942 180 aa11.68□□□□□ -0.54
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PTPRO-201ENST00000281171 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRO-201ENST00000281171 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRO-201ENST00000281171 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PTPRO-201ENST00000281171 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PTPRO-201ENST00000281171 C2orf66Q6UXQ4 117 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRO-201ENST00000281171 PRSS22Q9GZN4 317 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRO-201ENST00000281171 CELA3BP08861 270 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRO-201ENST00000281171 MINOS1Q5TGZ0 78 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRO-201ENST00000281171 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa11.61□□□□□ -0.55
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