RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDPQ00604 133 aa13.51□□□□□ -0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MOB4Q9Y3A3 225 aa13.44□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A6NNC1 897 aa13.44□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa13.44□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa13.44□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIP4P1Q86T03 277 aa13.44□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HTN3P15516 51 aa13.43□□□□□ -0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERVK11-1P61568 191 aa13.43□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF124Q15973 351 aa13.43□□□□□ -0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF726P1Q15940 193 aa13.42□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFS8O00217 210 aa13.42□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ST20Q9HBF5 79 aa13.42□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAV2Q8IVL1 2488 aa13.42□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C3orf79P0CE67 100 aa13.42□□□□□ -0.26
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