RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF747Q9BV97 191 aa11.92□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 Q9UFV3 132 aa11.92□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 DCHS1Q96JQ0 3298 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 C7orf71A4D174 169 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 OVOL3O00110 214 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 PRRG2O14669 202 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 IGLC1P0CG04 106 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 CCL3L1P16619 93 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM108Q6UXF1 575 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 OTORQ9NRC9 128 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 SPTA1P02549 2419 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 POLEQ07864 2286 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 PLP1P60201 277 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 C3orf36Q3SXR2 165 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 VMA21Q3ZAQ7 101 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 PVRIGQ6DKI7 326 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf46Q8TAG6 207 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 CEP295Q9C0D2 2601 aa11.91□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GUT8 65 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 GATD1Q8NB37 220 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 C16orf97H3BN30 126 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A17O43808 307 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 CSN1S1P47710 185 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM97Q5BJF2 176 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM116Q8NCL8 245 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM186Q96B77 213 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 CSTL1Q9H114 145 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 TPSG1Q9NRR2 321 aa11.9□□□□□ -0.5
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV2-11P01706 119 aa11.89□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 RIGQ13278 110 aa11.89□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 HCP5Q6MZN7 132 aa11.89□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 OR10AG1Q8NH19 301 aa11.89□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 DPF1Q92782 380 aa11.89□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 BSPH1Q075Z2 132 aa11.89□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 FOXE3Q13461 319 aa11.89□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 PRNTQ86SH4 94 aa11.89□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 TPRP12270 2363 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa11.89□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa11.89□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 GFRALQ6UXV0 394 aa11.89□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 FA2HQ7L5A8 372 aa11.89□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 CUL9Q8IWT3 2517 aa11.88□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 GAGE10A6NGK3 116 aa11.88□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 NCR2O95944 276 aa11.88□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 ARMS2P0C7Q2 107 aa11.88□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa11.88□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00311Q8N616 119 aa11.88□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 CCL17Q92583 94 aa11.88□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 HIGD1AQ9Y241 93 aa11.88□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 PPIAL4DF5H284 164 aa11.88□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 SNAI2O43623 268 aa11.88□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 ADIPOQQ15848 244 aa11.88□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM200BQ69YZ2 307 aa11.88□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 TEX45Q8NA69 505 aa11.88□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM14CQ9P0S9 112 aa11.88□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GW15 77 aa11.87□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 FGF6P10767 208 aa11.87□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 UFSP1Q6NVU6 142 aa11.87□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf31Q8N9H6 132 aa11.87□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa11.87□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 TNFRSF1AP19438 455 aa11.87□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa11.87□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 Q71RC1 249 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF785A8K8V0 405 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 C17orf100A8MU93 164 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 MC5RP33032 325 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 NBASA2RRP1 2371 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 H3BRM9 83 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 LGALS7P47929 136 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 PAX2Q02962 417 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 RITA1Q96K30 269 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 MEGF9Q9H1U4 602 aa11.86□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 C9orf118A6NHY6 69 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 THBDP07204 575 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 NUP37Q8NFH4 326 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 OR1N2Q8NGR9 330 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 AP1S3Q96PC3 154 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 A6NDN8 102 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 FCN3O75636 299 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 LYZP61626 148 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 PLXNB1O43157 2135 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 BSNQ9UPA5 3926 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 UQCRFS1P47985 274 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 FOXC1Q12948 553 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.2 ms