RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q OCA5P38738 679 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data2.71□□□□□ -1.98not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q MGS1P40151 587 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YFL015CP43578 164 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL058CP53947 316 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q USA1Q03714 838 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q NTG2Q08214 380 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q AIM41Q12032 185 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOR111WQ99210 232 aa2.71□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YAP1P19880 650 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q RNR3P21672 869 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YIL092WP40497 633 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRM2P40534 656 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q CFD1P40558 293 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q IES1P43579 692 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q ENP2P48234 707 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q SAP4P53036 818 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL193WP53870 558 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q NOP15P53927 220 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR111WQ12528 110 aa2.7□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPT10P38146 199 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDS1P38221 457 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q TDA3P38758 523 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q WAR1Q03631 944 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q ARR3Q06598 404 aa2.69□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q BI2P03873 423 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q AAC1P04710 309 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data2.68□□□□□ -1.98not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q CKB2P38930 258 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q DUN1P39009 513 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR124WP39523 943 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q LRO1P40345 661 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q TPO3Q06451 622 aa2.68□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YER190C-BP0CX94 160 aa2.67□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YEL077W-AP0CX95 160 aa2.67□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGR296C-BP0CX96 160 aa2.67□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPL283W-BP0CX97 160 aa2.67□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR204C-AP0CX98 160 aa2.67□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q GCS1P35197 352 aa2.67□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YAT2P40017 923 aa2.67□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YIL024CP40543 189 aa2.67□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q IRC7P43623 340 aa2.67□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q SAE2P46946 345 aa2.67□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q TIM50Q02776 476 aa2.67□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YCG1Q06680 1035 aa2.67□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q SRL1Q08673 210 aa2.67□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q BUD7Q08754 746 aa2.67□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q CET1O13297 549 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJL193WP39542 402 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q RAD26P40352 1085 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q COP1P53622 1201 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q TFB2Q02939 513 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q HRD3Q05787 833 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q CRT10Q08226 957 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q APM4Q99186 491 aa2.66□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEC3P33332 1336 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR085WP0CF18 432 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q VPS33P20795 691 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJU2P28320 278 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEC65P29478 273 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q MF(ALPHA)2P32435 120 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRP8P38961 392 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPL071CQ02864 156 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q HER1Q12276 1246 aa2.65□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q MTC7P32633 139 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATO2P32907 282 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q MAF1P41910 395 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q GZF3P42944 551 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDL183CP48569 320 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q SDA1P53313 767 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q MTD1Q02046 320 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q VTC3Q02725 835 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q HFI1Q12060 488 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q AIM44Q99299 758 aa2.64□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPT1P01123 206 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q HMG2P12684 1045 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q AIM17P23180 465 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q YCP4P25349 247 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q COQ3P27680 312 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q SFP1P32432 683 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q OAF3P36023 863 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q TOM71P38825 639 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q HXT6P39003 570 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q HXT7P39004 570 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q CIR1P42940 261 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJR096WP47137 282 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGR153WP48238 217 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q BOP3P53958 396 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q PCL8Q08966 492 aa2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q AHA1Q12449 350 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q YEL076C-AP0CX16 216 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR464WP0CX17 216 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q GLN4P13188 809 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q CBP3P21560 335 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q DID4P36108 232 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q EHT1P38295 451 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHR033WP38690 423 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q MTG2P38860 518 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(UCA)QtW(UCA)Q YEL076CP39971 216 aa2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.7 ms