RNA–Protein interactions for RNA: YPL147W

PXA1, Transcript of Subunit of a heterodimeric peroxisomal ABC transport complex, yeast

Gene PXA1, Length 2,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PXA1	YPL147W	SUR2	P38992	349 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YIL089W	P40500	205 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	COG2	P53271	262 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PUS6	P53294	404 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ESBP6	P53918	673 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	VAC7	P53950	1165 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ARP10	Q04549	284 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	GMC2	Q06201	188 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	BCP1	Q06338	283 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SNA4	Q07549	140 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	DAL7	P21826	554 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PTP1	P25044	335 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	GPI10	P30777	616 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	STP2	P38704	541 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ACA1	P39970	489 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YEL023C	P39992	682 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	JLP2	P40206	208 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YIL092W	P40497	633 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PNP1	Q05788	311 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	BI4	P03879	638 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PRB1	P09232	635 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	AAC3	P18238	307 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	MND2	P40577	368 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YJR098C	P47139	656 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	TUB4	P53378	473 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
PXA1	YPL147W	VHS3	Q08438	674 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	DDC1	Q08949	612 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	MMP1	Q12372	583 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	GIS3	Q12418	502 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SET6	Q12529	373 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	GAL2	P13181	574 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	MET8	P15807	274 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ATP11	P32453	318 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SUR1	P33300	382 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SOH1	P38633	127 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YHL017W	P38745	532 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YHR182W	P38870	785 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	NET1	P47035	1189 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	GCV2	P49095	1034 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PCL10	P53124	433 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ASI1	P54074	624 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ARP4	P80428	489 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YMR155W	Q03795	547 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ESC2	Q06340	456 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	RAD59	Q12223	238 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	RAV1	P47104	1357 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	HIS3	P06633	220 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YML002W	P0CF17	737 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	CMK2	P22517	447 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	VPS34	P22543	875 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SRP101	P32916	621 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	MRPL37	P36532	105 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	TAT2	P38967	592 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PCI8	P40512	444 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	STR2	P47164	639 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	TIM10	P87108	93 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YPL107W	Q02873	248 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ABZ2	Q03266	374 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	NHX1	Q04121	633 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	ARA2	Q04212	335 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SPC24	Q04477	213 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	BLS1	Q06071	122 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YPD1	Q07688	167 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	GPA1	P08539	472 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	WHI2	P12611	486 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	UTR1	P21373	530 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	EMC1	P25574	760 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SUA5	P32579	426 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SMC1	P32908	1225 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	SRL3	P36167	246 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	YHL008C	P38750	627 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	PIK1	P39104	1066 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PXA1	YPL147W	BOL3	P39724	118 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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