RNA–Protein interactions for RNA: YOR193W

PEX27, Transcript of Peripheral peroxisomal membrane protein, yeast

Gene PEX27, Length 1,131 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX27	YOR193W	DUN1	P39009	513 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	OPT1	P40897	799 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	TDA10	P42938	290 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	TGS1	Q12052	315 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	YEL025C	P39991	1188 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	CCL1	P37366	393 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	BRN1	P38170	754 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	EHT1	P38295	451 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	CKB2	P38930	258 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	LRO1	P40345	661 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	USA1	Q03714	838 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	PCL8	Q08966	492 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	HXT7	P39004	570 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	SAE2	P46946	345 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	YJR096W	P47137	282 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	YDL183C	P48569	320 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	YMR085W	P0CF18	432 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	SEC65	P29478	273 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	OSW7	P43611	510 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	WAR1	Q03631	944 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PEX27	YOR193W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
PEX27	YOR193W	YPR089W	O13585	888 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	YCG1	Q06680	1035 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	AIM41	Q12032	185 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	HER1	Q12276	1246 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	ECM9	Q02202	377 aa		5	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	HRD3	Q05787	833 aa		5	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	CDC26	P14724	124 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
PEX27	YOR193W	OAF3	P36023	863 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	FAT1	P38225	669 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	YHR033W	P38690	423 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	YIL024C	P40543	189 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	YGR153W	P48238	217 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	NUP53	Q03790	475 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	TPO3	Q06451	622 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	HFI1	Q12060	488 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	HMG2	P12684	1045 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	VID28	P40547	921 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	APM4	Q99186	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEX27	YOR193W	AAC1	P04710	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	MGM1	P32266	881 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	GCS1	P35197	352 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	YJL193W	P39542	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	CFD1	P40558	293 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	MAF1	P41910	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	VPS33	P20795	691 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	YHM2	Q04013	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	YIL092W	P40497	633 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	IRC7	P43623	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
PEX27	YOR193W	CYK3	Q07533	885 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	SFP1	P32432	683 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	YNL092W	P53934	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	ENT2	Q05785	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	BUD7	Q08754	746 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	AIM44	Q99299	758 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEX27	YOR193W	ATO2	P32907	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	SRL1	Q08673	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	BI2	P03873	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEX27	YOR193W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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