RNA–Protein interactions for RNA: YML009C

MRPL39, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL39, Length 213 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL39	YML009C	SPO12	P17123	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	MET22	P32179	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	MRPL40	P36534	297 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SWC5	P38326	303 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	LAM1	P38851	1228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	EXO1	P39875	702 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	TMA108	P40462	946 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YIL054W	P40524	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YIR007W	P40566	764 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	RSM7	P47150	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	MRX6	P48564	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	NUP84	P52891	726 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YGR021W	P53212	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	JJJ1	P53863	590 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YNL108C	P53929	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	RAD3	P06839	778 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	ADD66	P36040	267 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	MIC60	P36112	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	PIK1	P39104	1066 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SPC72	P39723	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	GIP4	P39732	760 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	TMN3	P40071	706 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	ATG3	P40344	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	VEL1	P53058	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	PEX13	P80667	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	CDC55	Q00362	526 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	BET4	Q00618	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SMA1	Q02651	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	INA17	Q02888	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	RPN4	Q03465	531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	ADI1	Q03677	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	HPF1	Q05164	967 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	PEX15	Q08215	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	NDD1	Q08887	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
MRPL39	YML009C	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	MTF2	P10849	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	PDR1	P12383	1068 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	DAL81	P21657	970 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	ADY2	P25613	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	DBF4	P32325	704 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	PXA2	P34230	853 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	BLI1	P35727	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YJR061W	P40355	935 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	DAN4	P47179	1161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	ERG5	P54781	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	ARA2	Q04212	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	IVY1	Q04934	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	GRX8	Q05926	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	RSB1	Q08417	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SPO21	Q12411	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YJU3	P28321	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	FUI1	P38196	639 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	HIS2	P38635	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	ERP2	P39704	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	STL1	P39932	569 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	KHA1	P40309	873 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YJL132W	P47014	750 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	AIM23	P47015	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YNR063W	P53749	607 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRPL39	YML009C	ATG16	Q03818	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.4 ms