RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	GYP1	Q08484	637 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	TRE1	Q08919	783 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	PTC5	Q12511	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MRP13	P12686	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
CLF1	YLR117C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	HIR1	P32479	840 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	UBP11	P36026	717 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	STB6	P36085	766 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RDH54	P38086	958 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	GEM1	P39722	662 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MAM33	P40513	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	FMP32	P43557	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	BFA1	P47113	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	STB4	P50104	949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MET13	P53128	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	VAC7	P53950	1165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	UBX4	P54730	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MTC5	Q03897	1148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	NSE3	Q05541	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	HUA2	Q12134	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	NSI1	Q12457	570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RPN13	O13563	156 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	EXO70	P19658	623 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	OPI1	P21957	404 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MEF1	P25039	761 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	KIP2	P28743	706 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MEI4	P29467	408 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ZIP1	P31111	875 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MYO3	P36006	1272 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	NUP133	P36161	1157 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YBR139W	P38109	508 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RCK2	P38623	610 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	STS1	P38637	319 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
CLF1	YLR117C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	XKS1	P42826	600 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	ELP2	P42935	788 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	RAD17	P48581	401 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	MAL11	P53048	616 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	TAD1	P53065	400 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YNR063W	P53749	607 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	SHR3	Q02774	210 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CLF1	YLR117C	COR1	P07256	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PEP5	P12868	1029 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	COQ8	P27697	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	TFB1	P32776	642 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PXA2	P34230	853 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ECM31	P38122	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RCR1	P38212	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	GOS1	P38736	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RRF1	P38771	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MSE1	P48525	536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PEF1	P53238	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	COG2	P53271	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	INA17	Q02888	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	FDC1	Q03034	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	COQ9	Q05779	260 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	BCP1	Q06338	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SPO75	Q07798	868 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RAX1	Q08760	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	TRM8	Q12009	286 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CCP1	P00431	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	KAR1	P11927	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ALG1	P16661	449 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	DBF2	P22204	572 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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