RNA–Protein interactions for RNA: YLR078C

BOS1, Transcript of v-SNARE (vesicle specific SNAP receptor), yeast

Gene BOS1, Length 735 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BOS1	YLR078C	YJL193W	P39542	402 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BOS1	YLR078C	YEL020C	P39994	560 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BOS1	YLR078C	MIT1	P40002	666 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BOS1	YLR078C	MAD2	P40958	196 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BOS1	YLR078C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
BOS1	YLR078C	TRS23	Q03784	219 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BOS1	YLR078C	DIN7	Q12086	430 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BOS1	YLR078C	HOS1	Q12214	470 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BOS1	YLR078C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
BOS1	YLR078C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.66	□□□□□ -1.66
BOS1	YLR078C	PHO5	P00635	467 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	PCK1	P10963	549 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	PHO3	P24031	467 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	NIC96	P34077	839 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	SDS22	P36047	338 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	PIH1	P38768	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	YIP4	P53093	235 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	NUR1	Q12066	484 aa		4.65	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	URA3	P03962	267 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	HOP1	P20050	605 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	ARG1	P22768	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	SPO11	P23179	398 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	CNE1	P27825	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	SAW1	P39735	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	YNR071C	P53757	342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	TPK2	P06245	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	STE12	P13574	688 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	ADY2	P25613	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	DSS4	P32601	143 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	PPZ2	P33329	710 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	TGL1	P34163	548 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	ASK10	P48361	1146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	BUD17	P53727	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	TRI1	Q05024	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	TAF5	P38129	798 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	TGS1	Q12052	315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	LOT5	P34234	306 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	CCL1	P37366	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	RIM4	P38741	713 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	PAC2	P39937	518 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	MRK1	P50873	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	CPR8	P53728	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	USA1	Q03714	838 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	IOC4	Q04213	475 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	ATP4	P05626	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	CBP3	P21560	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	YKL133C	P36066	463 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	GSM1	P42950	618 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	YGL117W	P53133	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	MET14	Q02196	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	ARO10	Q06408	635 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	ARP7	Q12406	477 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	BNR1	P40450	1375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	ADH4	P10127	382 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	BET2	P20133	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	COQ6	P53318	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	HOF1	Q05080	669 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BOS1	YLR078C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	GAL1	P04385	528 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	WHI2	P12611	486 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	VPS34	P22543	875 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	YLF2	P38746	405 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	SWD1	P39706	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	COS12	P53053	380 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	ARG7	Q04728	441 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	MLC2	Q06580	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	ULA1	Q12059	462 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	PTP2	P29461	750 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	YMC1	P32331	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	FLO10	P36170	1169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	YPT10	P38146	199 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	STB5	P38699	743 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	IMA5	P40884	581 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	PIP2	P52960	996 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	SAP4	P53036	818 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BOS1	YLR078C	ACS1	Q01574	713 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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