RNA–Protein interactions for RNA: YKL093W

MBR1, Transcript of Protein involved in mitochondrial functions and stress response, yeast

Gene MBR1, Length 1,020 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MBR1	YKL093W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	PHO8	P11491	566 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	OCT1	P35999	772 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	GLG1	P36143	616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	MAL11	P53048	616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	ATG4	P53867	494 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	RPN13	O13563	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	GAL11	P19659	1081 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	MCD4	P36051	919 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	SFB3	P38810	929 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	GID8	P40208	455 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	CTR1	P49573	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	AFT2	Q08957	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	MLH3	Q12083	715 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	SWI1	P09547	1314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	SAC3	P46674	1301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	SPO11	P23179	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	PHO11	P35842	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	PHO12	P38693	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	GDH3	P39708	457 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	PAC2	P39937	518 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	ICT1	Q12385	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	THI4	P32318	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	ACA1	P39970	489 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	GET2	P40056	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	DOS2	P54858	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	MRK1	P50873	501 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	DNM1	P54861	757 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	PSF3	Q12146	194 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MBR1	YKL093W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	MIH1	P23748	554 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	TMT1	P32643	299 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	BCS1	P32839	456 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	MNN1	P39106	762 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	VAB2	P40003	282 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	LYS14	P40971	790 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	YFH7	P43591	353 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	YJR008W	P47085	338 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	ORC4	P54791	529 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	PEX1	P24004	1043 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	APT2	P36973	181 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	MDM12	Q92328	271 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	SEC6	P32844	805 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	SET3	P36124	751 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	NUP133	P36161	1157 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	YBL028C	P38202	106 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	MUP3	P38734	546 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	MAM1	P40065	302 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	CAF16	P43569	289 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	REC102	Q02721	264 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	OSW1	Q08692	278 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	DAP1	Q12091	152 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	SNF3	P10870	884 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	FUB1	P25659	250 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	EUG1	P32474	517 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	VID30	P53076	958 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	VPS34	P22543	875 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	YKR018C	P36114	725 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	YFL052W	P43551	465 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	YJR142W	P47173	342 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	THI22	Q06490	572 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	USV1	Q12132	391 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	CDC9	P04819	755 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.47	□□□□□ -1.69
MBR1	YKL093W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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