RNA–Protein interactions for RNA: YHR199C-A

NBL1, Transcript of Subunit of the conserved chromosomal passenger complex (CPC), yeast

Gene NBL1, Length 222 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NBL1	YHR199C-A	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	YEL025C	P39991	1188 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	LRO1	P40345	661 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	NET1	P47035	1189 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	WHI2	P12611	486 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	ATP12	P22135	325 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	DAL3	P32459	195 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	HXT4	P32467	576 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	YPT10	P38146	199 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	FRE7	Q12333	620 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
NBL1	YHR199C-A	AQY1	P0CD91	305 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	GAT1	P43574	510 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	SAP4	P53036	818 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	SEC5	P89102	971 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	USA1	Q03714	838 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	TGS1	Q12052	315 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	VPS33	P20795	691 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	RPC34	P32910	317 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	CCL1	P37366	393 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	YJL193W	P39542	402 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	EXO1	P39875	702 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	YFL015C	P43578	164 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NBL1	YHR199C-A	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	LOT5	P34234	306 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	BRN1	P38170	754 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	ATG36	P46983	293 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	PEF1	P53238	335 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	SKY1	Q03656	742 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	BEM3	P32873	1128 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	YEL076C	P39971	216 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	BST1	P43571	1029 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	IRC5	P43610	853 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	YJL043W	P47053	257 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	ATP23	P53722	227 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	ORM2	Q06144	216 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
NBL1	YHR199C-A	YPR027C	Q12079	277 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	RGT2	Q12300	763 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	MRPL9	P31334	269 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	TDA10	P42938	290 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	NMD5	P46970	1048 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	WAR1	Q03631	944 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	IRC3	Q06683	689 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	YOR378W	Q08902	515 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	PCL8	Q08966	492 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	RMP1	Q12530	201 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	AAC1	P04710	309 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	PCK1	P10963	549 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	AEP2	P22136	580 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	CWH43	P25618	953 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	EUG1	P32474	517 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	DSS4	P32601	143 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	APD1	P38281	316 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	UBP12	P39538	1254 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	NIT2	P47016	307 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	STP1	Q00947	519 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	GSY2	P27472	705 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	PEA2	P40091	420 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	OPT1	P40897	799 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	SAE2	P46946	345 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	DOS2	P54858	310 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	RSC9	Q03124	581 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	BSP1	Q06604	576 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	GEP3	Q08622	556 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	VPS5	Q92331	675 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	CDC5	P32562	705 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	EAF5	P39995	279 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	MNT2	P53059	558 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	YNL092W	P53934	400 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	CIR2	Q08822	631 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NBL1	YHR199C-A	YLR111W	Q12528	110 aa		3.1	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 127.2 ms