RNA–Protein interactions for RNA: YHR060W

VMA22, Transcript of Protein that is required for vacuolar H+-ATPase (V-ATPase) function, yeast

Gene VMA22, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA22	YHR060W	YAP1802	P53309	568 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	VPS9	P54787	451 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	YPS7	Q06325	596 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	STP4	Q07351	490 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	DIN7	Q12086	430 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	CKA1	P15790	372 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	PDX1	P16451	410 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	BYE1	P36106	594 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	IFA38	P38286	347 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	YBR225W	P38321	900 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SAK1	P38990	1142 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	GID8	P40208	455 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	UBP7	P40453	1071 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	RIM8	P53179	542 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SNO4	Q04902	237 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	TFC6	Q06339	672 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	CDA2	Q06703	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	HSP32	Q08992	237 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	YLR302C	O13544	120 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SOD2	P00447	233 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	BIK1	P11709	440 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	YBR138C	P38277	524 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	YBR259W	P38338	688 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	ECM1	P39715	212 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	YJR061W	P40355	935 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	JEM1	P40358	645 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	DJP1	P40564	432 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SPO1	P53541	631 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	TIM10	P87108	93 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	MFB1	Q04922	465 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	MCM21	Q06675	368 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
VMA22	YHR060W	GAL10	P04397	699 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	CTT1	P06115	562 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SPE1	P08432	466 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SEC15	P22224	910 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SED4	P25365	1065 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	MEF2	P39677	819 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	LYS14	P40971	790 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	BST1	P43571	1029 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	TAH11	P47112	604 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	PKH1	Q03407	766 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	VPS64	Q03944	604 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	AIM41	Q12032	185 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SWM1	Q12379	170 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	SEC12	P11655	471 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	KIN82	P25341	720 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	OCA4	P25366	362 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	RNQ1	P25367	405 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	RPC53	P25441	422 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	YBL029W	P38201	376 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	UBP5	P39944	805 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	VFA1	P40080	203 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	GSM1	P42950	618 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	RMD8	P43620	662 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	YGR016W	P53209	190 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	COX18	P53239	316 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	NNF2	P53253	936 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	ISA2	Q12425	185 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA22	YHR060W	URA3	P03962	267 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	HMG2	P12684	1045 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	IME1	P21190	360 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	MTH1	P35198	433 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	SET3	P36124	751 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
VMA22	YHR060W	BUD8	P41698	603 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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