RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	TGL1	P34163	548 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	UBP9	P39967	754 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	EAF5	P39995	279 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	VAB2	P40003	282 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MSS2	P40990	351 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PKP2	P53170	491 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	DAM1	P53267	343 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YNL181W	P53878	407 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ALF1	P53904	254 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	HFI1	Q12060	488 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RPN6	Q12377	434 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	EXO70	P19658	623 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	STB6	P36085	766 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	TMA108	P40462	946 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YDR090C	Q03193	310 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	WAR1	Q03631	944 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	TAF12	Q03761	539 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YDR338C	Q05497	695 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	DCC1	P25559	380 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	KIP1	P28742	1111 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SMF2	P38778	549 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	FMC1	P40491	155 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SFH1	Q06168	426 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	DPH6	Q12429	685 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PPH22	P23595	377 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RBK1	P25332	333 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PET127	P32606	800 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MIA40	P36046	403 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RRT2	P38332	387 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	GCV2	P49095	1034 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RET3	P53600	189 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YPL109C	Q02981	657 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	GIP3	Q03016	1276 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SKY1	Q03656	742 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MDM36	Q06820	579 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SHS1	Q07657	551 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	FRA1	Q07825	749 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MLS1	P30952	554 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	OAF3	P36023	863 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.81	□□□□□ -1.96	not detected
TOM1	YDR457W	YHR035W	P38769	630 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	GLC8	P41818	229 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YJL016W	P47072	561 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	AIM25	P47140	327 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ATP25	Q03153	612 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ADI1	Q03677	179 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	TPO1	Q07824	586 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YML133C	Q03099	1374 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YLL067C	Q07888	1374 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YLL066C	Q99208	1374 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	KIN28	P06242	306 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RAD7	P06779	565 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	TPO5	P36029	618 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MRX3	P38172	270 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YHR054C	P38780	354 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RSC30	P38781	883 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PFS1	P38872	237 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	AKR1	P39010	764 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	DOT5	P40553	215 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MAD3	P47074	515 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SNF12	P53628	566 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	APC4	Q04601	652 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SYO1	Q07395	620 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	STE6	P12866	1290 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	TUP1	P16649	713 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RAD24	P32641	659 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YET1	P35723	206 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	BCH2	P36122	765 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	2.81	□□□□□ -1.96	RIP-Chip
TOM1	YDR457W	RMD6	P39975	231 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	HXT8	P40886	569 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YAR1	P46683	200 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	GTO1	P48239	356 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YNR068C	P53754	272 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	TEP1	P53916	434 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	HIM1	Q06674	414 aa		2.81	□□□□□ -1.96

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