RNA–Protein interactions for RNA: YDR119W

VBA4, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene VBA4, Length 2,307 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA4YDR119W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W CIR2Q08822 631 aa3.4□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W RCN2Q12044 265 aa3.4□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W CDC19P00549 500 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W ADE3P07245 946 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W APE1P14904 514 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W RIT1P23796 513 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W CLB1P24868 471 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W MRPL16P38064 232 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W FLR1P38124 548 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W GIC1P38785 314 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W GCD10P41814 478 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W THI6P41835 540 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W DSD1P53095 428 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W FDC1Q03034 503 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W TRI1Q05024 226 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W DIN7Q12086 430 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W PRP28P23394 588 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W GYP6P32806 458 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W BCK2P33306 851 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W LOT5P34234 306 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W SIF2P38262 535 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W RPN3P40016 523 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W ATF1P40353 525 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W ZIM17P42844 174 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W NOP9P47077 666 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W MNT2P53059 558 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W SPO1P53541 631 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W TOF1P53840 1238 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W ARP4P80428 489 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W SRT1Q03175 343 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W YMR210WQ03649 449 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W PHO92Q06390 306 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W PLP2Q12017 286 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W COX17Q12287 69 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W GRX6Q12438 231 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W YOL159C-AQ3E769 90 aa3.39□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W YLR302CO13544 120 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W PRC1P00729 532 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W OM45P16547 393 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W NIP1P32497 812 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W CAB3P36076 571 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W YBL029WP38201 376 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W POA1P38218 177 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W FSH1P38777 243 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W MTG2P38860 518 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W FLC2P39719 783 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W BUD16P39988 312 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W CEP3P40969 608 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W LEM3P42838 414 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W YJR098CP47139 656 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W IMA1P53051 589 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W YGR045CP53229 120 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W BRE5P53741 515 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W YNR068CP53754 272 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W YNR071CP53757 342 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W AAD4Q07747 329 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data3.38□□□□□ -1.87not detected
VBA4YDR119W NMD4Q12129 218 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W MRP10O75012 95 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W TUB2P02557 457 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W PCK1P10963 549 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W LAT1P12695 482 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data3.38□□□□□ -1.87not detected
VBA4YDR119W CLB3P24870 427 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W RSC6P25632 483 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W FRD1P32614 470 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W SPT8P38915 602 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W VPS45P38932 577 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W KEL2P50090 882 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W UBP15P50101 1230 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W HFM1P51979 1187 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W HED1Q03937 162 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W SKG3Q06315 1026 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W MDY2Q12285 212 aa3.38□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W CBS1P14066 229 aa3.37□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W HNM1P19807 563 aa3.37□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W YCK1P23291 538 aa3.37□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W PRE8P23639 250 aa3.37□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W EFT1P32324 842 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W MRP20P32387 263 aa3.37□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W TIF5P38431 405 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W LYS9P38999 446 aa3.37□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W PSD1P39006 500 aa3.37□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W NAS2P40555 220 aa3.37□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W MKT1P40850 830 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W YFL054CP43549 646 aa3.37□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W AGX1P43567 385 aa3.37□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W MTC3P53077 123 aa3.37□□□□□ -1.87
VBA4YDR119W CUL3P53202 744 aa3.37□□□□□ -1.87
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