RNA–Protein interactions for RNA: Q0065

AI4, Transcript of Endonuclease I-SceII, yeast

Gene AI4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI4	Q0065	NUR1	Q12066	484 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	PHO81	P17442	1178 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	CTP1	P38152	299 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	MNT2	P53059	558 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	MDR1	P53258	950 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	TEP1	P53916	434 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	YCG1	Q06680	1035 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	PSR2	Q07949	397 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	SEC12	P11655	471 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	MTC7	P32633	139 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	PHO11	P35842	467 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	PHO12	P38693	467 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	FTR1	P40088	404 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	ARG2	P40360	574 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	QRI7	P43122	407 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	ATG4	P53867	494 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	ATG16	Q03818	150 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	YOL114C	Q12322	202 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	MSH1	P25846	959 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	EMP70	P32802	667 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	ORC2	P32833	620 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	CDS1	P38221	457 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	YHL041W	P38730	149 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	RIP-Chip
AI4	Q0065	YEL025C	P39991	1188 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	MAD2	P40958	196 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	MPS3	P47069	682 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	RFX1	P48743	811 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	CRD1	Q07560	283 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	DIN7	Q12086	430 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	MSS18	P08593	268 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.04	□□□□□ -1.76	not detected
AI4	Q0065	ACA1	P39970	489 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	YEL020C	P39994	560 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	KHA1	P40309	873 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	THI6	P41835	540 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	CTR1	P49573	406 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	YGR021W	P53212	290 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	YNR071C	P53757	342 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	PIF1	P07271	859 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	FUB1	P25659	250 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	APL3	P38065	1025 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	SWD1	P39706	426 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	YDL086W	Q07505	273 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	IZH3	Q07959	543 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	RPN13	O13563	156 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	VPS33	P20795	691 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	CBP3	P21560	335 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	YJL193W	P39542	402 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	TMN3	P40071	706 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	LRO1	P40345	661 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	NDC80	P40460	691 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	YDL183C	P48569	320 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	MLH3	Q12083	715 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
AI4	Q0065	ADH4	P10127	382 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	IES5	P40060	125 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	YGR151C	P53287	111 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	ARR3	Q06598	404 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	URA3	P03962	267 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	TUP1	P16649	713 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	MSM1	P22438	575 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	GLG1	P36143	616 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	APM3	P38153	483 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	PPE1	P38796	400 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	GSM1	P42950	618 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	AAD4	Q07747	329 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	USV1	Q12132	391 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	ARG1	P22768	420 aa		4	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	RIM13	Q03792	727 aa		4	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	UFO1	Q04511	668 aa		4	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	VPS34	P22543	875 aa		4	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	GMH1	P36125	273 aa		4	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	FUI1	P38196	639 aa		4	□□□□□ -1.77
AI4	Q0065	SAP185	P40856	1058 aa		4	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 90.4 ms