RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa13.13□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM205AQ6ZU69 1335 aa13.13□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXB7P09629 217 aa13.12□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAPN2P17655 700 aa13.12□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MOGSQ13724 837 aa13.12□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa13.12□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKLE1Q8NAG6 615 aa13.12□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV5-2P06315 115 aa13.11□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM32Q13049 653 aa13.11□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPAT2Q6NUI2 795 aa13.11□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX58O95786 925 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IRF5Q13568 498 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRIK5Q16478 980 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC146Q8IYE0 955 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF341Q9BYN7 854 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEMA6BQ9H3T3 888 aa13.1□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOSL2P15408 326 aa13.09□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCAF15Q66K64 600 aa13.09□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COA7Q96BR5 231 aa13.09□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNH4Q9UQ05 1017 aa13.09□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PFASO15067 1338 aa13.09□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLSPNQ9HAW4 1339 aa13.09□□□□□ -0.31
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MGAMO43451 1857 aa13.08□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PI4KAP2A4QPH2 592 aa13.08□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TJAP1Q5JTD0 557 aa13.08□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GADL1Q6ZQY3 521 aa13.08□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa13.08□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMOD2Q9NZR1 351 aa13.08□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARAP2Q8WZ64 1704 aa13.08□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa13.07□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GYG1P46976 350 aa13.07□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NEXNQ0ZGT2 675 aa13.07□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP3K12Q12852 859 aa13.07□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC26Q2I0M4 334 aa13.07□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa13.07□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOOK2Q96ED9 719 aa13.07□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MBIPQ9NS73 344 aa13.07□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM35Q9UPQ4 493 aa13.07□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHMP3Q9Y3E7 222 aa13.07□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NEURL1BA8MQ27 555 aa13.06□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H7C1W4 665 aa13.06□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HMGCRP04035 888 aa13.06□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCP10Q12799 353 aa13.05□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KSR2Q6VAB6 950 aa13.05□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OGDHLQ9ULD0 1010 aa13.05□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZHX2Q9Y6X8 837 aa13.05□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYH3P11055 1940 aa13.05□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSF1RP07333 972 aa13.04□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM83AQ86UY5 434 aa13.04□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP38Q8NB14 1042 aa13.04□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEKT1Q969V4 418 aa13.04□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CXCL11O14625 94 aa13.03□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SHHQ15465 462 aa13.03□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPM1EQ8WY54 764 aa13.03□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BDP1A6H8Y1 2624 aa13.03□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C9orf50Q5SZB4 431 aa13.02□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C8orf58Q8NAV2 365 aa13.02□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLA2G12BQ9BX93 195 aa13.02□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNNM1Q9NRU3 951 aa13.02□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF112Q9UJU3 913 aa13.02□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL6A1P12109 1028 aa13.01□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYP2B6P20813 491 aa13.01□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GCKRQ14397 625 aa13.01□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAF7LQ5H9L4 462 aa13.01□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa13.01□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VPS37DQ86XT2 251 aa13.01□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIB2Q92519 343 aa13.01□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa13.01□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DOCK3Q8IZD9 2030 aa13□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM75PA6NK02 468 aa13□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CASP7P55210 303 aa13□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC30Q5VVM6 783 aa13□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZDHHC15Q96MV8 337 aa13□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PICK1Q9NRD5 415 aa13□□□□□ -0.33
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 196.8 ms